Cardiovascular Health Status And Genetic Risk In Survivors of Childhood Neuroblastoma and Nephroblastoma Treated With Doxorubicin: Protocol of the Pharmacogenetic Part of the LESS-Anthra Cross-Sectional Cohort Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In childhood cancer survivors (survival of 5 years or more after diagnosis), cardiac toxicity is the most common nonmalignant cause of death attributed to treatment-related consequences. Identifying patients at risk of developing late cardiac toxicity is therefore crucial to improving treatment outcomes. The use of genetic markers has been proposed, together with clinical risk factors, to predict individual risk of cardiac toxicity from cancer therapies, such as doxorubicin. OBJECTIVE: The primary aim of this study is to evaluate the value of multimarker genetic testing for RARG rs2229774, UGT1A6 rs17863783, and SLC28A3 rs7853758 for predicting doxorubicin-induced cardiotoxicity. The secondary aim is to replicate previously described associations of candidate genetic markers with doxorubicin-induced cardiotoxicity. Moreover, we will evaluate the prevalence of cardiovascular dysfunction in childhood cancer survivors after neuroblastoma or nephroblastoma. METHODS: This is the pharmacogenetic substudy of the research project Structural Optimization for Children With Cancer After Anthracycline Therapy (LESS-Anthra). We invited 2158 survivors of childhood neuroblastoma or nephroblastoma treated with doxorubicin according to the trial protocols of SIOP 9/GPOH, SIOP 93-01/GPOH, SIOP 2001/GPOH, NB 90, NB 97, or NB 2004 to participate in this prospective cross-sectional cohort study. The study participants underwent a cardiological examination and were asked to provide a blood or saliva sample for genotyping. The study participants' health statuses and cardiovascular diagnoses were recorded using a questionnaire completed by the cardiologist. Digital echocardiographic data were centrally evaluated to determine the contractile function parameters. Medical data on the tumor diagnosis and treatment protocol were taken from the study documentation. Survivors were screened for variants of several candidate genes by TaqMan genotyping. RESULTS: This study includes 657 survivors treated with doxorubicin for childhood cancer, the largest German cohort assembled to date to investigate cardiovascular late effects. Data analyses are yet to be completed. CONCLUSIONS: This study will define the genetic risk related to 3 marker genes proposed in a pharmacogenetic guideline for risk assessment. Moreover, the results of this study will show the prevalence of cardiovascular dysfunction in survivors of pediatric neuroblastoma or nephroblastoma who were treated with doxorubicin. The results will help to improve primary treatment and follow-up care, thus reducing cardiovascular late effects in the growing population of childhood cancer survivors. TRIAL REGISTRATION: German Clinical Trials Register DRKS00015084; https://www.drks.de/drks_web/navigate.do?navigationId=trial.HTML&TRIAL_ID=DRKS00015084. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/27898.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».