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Enregistrement W3194890103 · doi:10.1200/cci.21.00040

Cancer Informatics for Cancer Centers: Scientific Drivers for Informatics, Data Science, and Care in Pediatric, Adolescent, and Young Adult Cancer

2021· article· en· W3194890103 sur OpenAlexaff
Anthony R. Kerlavage, Anne C. Kirchhoff, Jaime M. Guidry Auvil, Norman E. Sharpless, Kara L. Davis, Karlyne M. Reilly, Gregory H. Reaman, Lynne Penberthy, Dennis Deapen, Amie E. Hwang, Eric B. Durbin, Sara L. Gallotto, Richard Aplenc, Samuel L. Volchenboum, Allison P. Heath, Bruce J. Aronow, Jinghui Zhang, Olena M. Vaske, Todd A. Alonzo, Paul C. Nathan, Jenny N. Poynter, Greg Armstrong, Erin E. Hahn, Karen J. Wernli, Casey S. Greene, Jack DiGiovanna, Adam Resnick, Eve Shalley, Sorena Nadaf, Warren A. Kibbe

Notice bibliographique

RevueJCO Clinical Cancer Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChildhood Cancer Survivors' Quality of Life
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésCancerInformaticsHealth informaticsMedicinePolitical scienceInternal medicineNursingPublic health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer Informatics for Cancer Centers (CI4CC) is a grassroots, nonprofit 501c3 organization intended to provide a focused national forum for engagement of senior cancer informatics leaders, primarily aimed at academic cancer centers anywhere in the world but with a special emphasis on the 70 National Cancer Institute-funded cancer centers. This consortium has regularly held topic-focused biannual face-to-face symposiums. These meetings are a place to review cancer informatics and data science priorities and initiatives, providing a forum for discussion of the strategic and pragmatic issues that we faced at our respective institutions and cancer centers. Here, we provide meeting highlights from the latest CI4CC Symposium, which was delayed from its original April 2020 schedule because of the COVID-19 pandemic and held virtually over three days (September 24, October 1, and October 8) in the fall of 2020. In addition to the content presented, we found that holding this event virtually once a week for 6 hours was a great way to keep the kind of deep engagement that a face-to-face meeting engenders. This is the second such publication of CI4CC Symposium highlights, the first covering the meeting that took place in Napa, California, from October 14-16, 2019. We conclude with some thoughts about using data science to learn from every child with cancer, focusing on emerging activities of the National Cancer Institute's Childhood Cancer Data Initiative.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,070
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,087
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0700,087
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,009
Études des sciences et des technologies0,0100,008
Communication savante0,0280,025
Science ouverte0,0040,021
Intégrité de la recherche0,0070,030
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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