Association between mid-childhood gut microbiome and neurocognitive outcomes in GESTE, a Canadian cohort Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIM: The microbiome is a dynamic ecosystem that may modulate neurodevelopment through the gut-brain axis. Altered microbial gut composition has been linked to childhood temperament and autism, however, to date, no studies estimate the association between the gut microbiome and neurocognitive function in a healthy mid-childhood population METHODS: Participants were 80 Caucasian children from the GESTation and the Environment, GESTE, a longitudinal birth cohort based in Sherbrooke, Canada. At the 6-8 years follow-up visit stool samples were analyzed with 16S rRNA sequencing. Intra-individual (alpha) microbiome diversity was computed using diversity (Shannon and Gini-Simpson) and dominance indices (Simpson and McNaughton’s). Inter-individual microbiome (beta) diversity was calculated using weighted and unweighted UniFrac, Bray-Curtis and Jaccard distances. Furthermore, bacterial phylum and family levels associations were examined. At the same follow-up visit, the children completed the WISC-IV (Wechsler Intelligence Scale for Children) questionnaire which includes seven subtests (block design, coding, total, forward and reverse digit span, information, and vocabulary). The associations between microbiome diversity, bacterial phyla and families and cognitive scores were assessed using generalized linear regression models adjusted for confounders, e.g., sociodemographic characteristics, breastfeeding and mode of delivery. Missing data points were imputed. The results were corrected using FDR method. RESULTS:Among the study cohort, 52% boys, 80% breastfed and 80% born vaginally with mean age, 6.5 years ± 0.5 at follow-up. Lower Shannon (β =-1.05, 95%CI: -1.71-0.39, p=0.02) and Gini-Simpson (β =1.04, 95%CI: -1.77-0.41, p=0.02) indices were associated with better long-term memory. No associations were observed for beta diversity. Higher total digit span was marginally associated with lower Desulfobacterota phylum abundance (β =-0.23, SE:0.09, p=0.09). CONCLUSIONS:Our findings suggest that while a healthier gut as measured by indices of microbial diversity was not associated with improved long-term memory, lower level of Desulfobacterota phylum bacterial taxa may be beneficial for the development of auditory working memory. KEYWORDS: Microbiome, Neurodevelopmental outcomes, Epidemiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».