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Enregistrement W3195314024 · doi:10.1080/07060661.2021.1966651

Mapping stem rust resistance loci effective in Kenya in Canadian spring wheat (Triticum aestivum L.) lines ‘AAC Prevail’ and ‘BW961’

2021· article· en· W3195314024 sur OpenAlexafffundvenueabout
Firdissa E. Bokore, Richard D. Cuthbert, Colin W. Hiebert, T. Fetch, Curtis Pozniak, Amidou N’Diaye, Yuefeng Ruan, Brad Meyer, R. E. Knox

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesWestern Grains Research FoundationAlberta Wheat CommissionManitoba Agriculture, Food and Rural DevelopmentMinistry of Agriculture - SaskatchewanGenome Canada
Mots-clésStem rustQuantitative trait locusDoubled haploidyBiologyPopulationGenotypingRust (programming language)GeneticsGenotypeAgronomyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study was conducted to identify and map stem rust resistance genes in Canada Western Red Spring (CWRS) wheat variety ‘AAC Prevail’ and elite line ‘BW961ʹ. A population of 227 doubled haploid lines from ‘AAC Prevail’/‘BW961ʹ and parents were evaluated for their response to stem rust (Puccinia graminis) at Njoro, Kenya, from 2016–2019 and genotyped using a targeted genotyping by sequencing SeqSNP assay. ‘AAC Prevail’ and ‘BW961ʹ were susceptible to race TTKSK in seedling tests in Canada. We identified stable QTL (significant in most environments tested) associated with field stem rust resistance on chromosome arms 2BS and 7AL, and minor QTL on 5AL, 6AS and 7BL. The QTL on 5AL, 7AL and 7BL were contributed by ‘AAC Prevail’, while those on 2BS and 6AS were contributed by ‘BW961ʹ. The QTL on 7AL was detected across all environments and explained 9.5% to 39% of the variation in disease severity (DS) and infection response (IR). The QTL on 2BS was associated with DS in all environments and in three of four environments for IR, and explained 4.8% to 12% of the variation in DS and IR. In two environments, the combination of 2BS and 7AL significantly enhanced field stem rust resistance compared with either QTL singly. Using SNP markers closely linked to the novel QTL on 2BS and 7AL, Kompetitive Allele Specific PCR markers were developed and validated in the population. These results provide breeders with new information and markers to utilize these sources of stem rust resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,523
Score d'incertitude au seuil0,959

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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