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Enregistrement W3195505129 · doi:10.1186/s13063-021-05489-x

The role of machine learning in clinical research: transforming the future of evidence generation

2021· review· en· W3195505129 sur OpenAlexaff
E. Hope Weissler, Tristan Naumann, Tomas Andersson, Rajesh Ranganath, Olivier Elemento, Yuan Luo, Daniel F. Freitag, James Benoit, Michael C. Hughes, Faisal M. Khan, Paul Slater, Khader Shameer, Matthew T. Roe, Emmette R. Hutchison, Scott H. Kollins, Uli C. Broedl, Zhaoling Meng, Jennifer Wong, Lesley H. Curtis, Erich Huang, Marzyeh Ghassemi

Notice bibliographique

RevueTrials · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueArtificial Intelligence in Healthcare and Education
Établissements canadiensUniversity of TorontoVector InstituteBoehringer Ingelheim (Canada)University of Alberta
Organismes subventionnairesMinistry of Science, ICT and Future PlanningDuke Clinical Research InstituteNovo NordiskVerily Life SciencesJanssen PharmaceuticalsMyoKardiaRegeneron PharmaceuticalsBayerEli Lilly and CompanyAstraZenecaPfizerAmgenMicrosoftPatient-Centered Outcomes Research InstituteCytokineticsSanofiJanssen BiotechAmerican Heart Association
Mots-clésClinical trialMedicineStakeholderClinical researchData collectionAnalyticsKnowledge managementPublic relationsData sciencePathologyPolitical scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Interest in the application of machine learning (ML) to the design, conduct, and analysis of clinical trials has grown, but the evidence base for such applications has not been surveyed. This manuscript reviews the proceedings of a multi-stakeholder conference to discuss the current and future state of ML for clinical research. Key areas of clinical trial methodology in which ML holds particular promise and priority areas for further investigation are presented alongside a narrative review of evidence supporting the use of ML across the clinical trial spectrum. RESULTS: Conference attendees included stakeholders, such as biomedical and ML researchers, representatives from the US Food and Drug Administration (FDA), artificial intelligence technology and data analytics companies, non-profit organizations, patient advocacy groups, and pharmaceutical companies. ML contributions to clinical research were highlighted in the pre-trial phase, cohort selection and participant management, and data collection and analysis. A particular focus was paid to the operational and philosophical barriers to ML in clinical research. Peer-reviewed evidence was noted to be lacking in several areas. CONCLUSIONS: ML holds great promise for improving the efficiency and quality of clinical research, but substantial barriers remain, the surmounting of which will require addressing significant gaps in evidence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,101
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,170
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,899
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1010,170
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0080,007
Études des sciences et des technologies0,0010,007
Communication savante0,0090,012
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0070,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,928
Tête enseignante GPT0,704
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations282
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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