MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3195517888 · doi:10.1172/jci149236

Group IIA secreted phospholipase A2 is associated with the pathobiology leading to COVID-19 mortality

2021· article· en· W3195517888 sur OpenAlexaff
Justin M. Snider, Jeehyun Karen You, Xia Wang, Ashley J. Snider, Brian Hallmark, Manja Zec, Michael C. Seeds, Susan Sergeant, Laurel Johnstone, Qiuming Wang, Ryan Sprissler, Tara F. Carr, Karen Lutrick, Sairam Parthasarathy, Christian Bime, Hao Helen Zhang, Chiara Luberto, Richard R. Kew, Yusuf A. Hannun, Stefano Guerra, Charles E. McCall, Maurizio Del Poeta, Floyd H. Chilton

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensImpact
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Environmental Health SciencesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineInternal medicineCohortDiseaseBlood urea nitrogenGastroenterologyKidneyInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is an urgent need to identify the cellular and molecular mechanisms responsible for severe COVID-19 that results in death. We initially performed both untargeted and targeted lipidomics as well as focused biochemical analyses of 127 plasma samples and found elevated metabolites associated with secreted phospholipase A2 (sPLA2) activity and mitochondrial dysfunction in patients with severe COVID-19. Deceased COVID-19 patients had higher levels of circulating, catalytically active sPLA2 group IIA (sPLA2-IIA), with a median value that was 9.6-fold higher than that for patients with mild disease and 5.0-fold higher than the median value for survivors of severe COVID-19. Elevated sPLA2-IIA levels paralleled several indices of COVID-19 disease severity (e.g., kidney dysfunction, hypoxia, multiple organ dysfunction). A decision tree generated by machine learning identified sPLA2-IIA levels as a central node in the stratification of patients who died from COVID-19. Random forest analysis and least absolute shrinkage and selection operator-based (LASSO-based) regression analysis additionally identified sPLA2-IIA and blood urea nitrogen (BUN) as the key variables among 80 clinical indices in predicting COVID-19 mortality. The combined PLA-BUN index performed significantly better than did either one alone. An independent cohort (n = 154) confirmed higher plasma sPLA2-IIA levels in deceased patients compared with levels in plasma from patients with severe or mild COVID-19, with the PLA-BUN index-based decision tree satisfactorily stratifying patients with mild, severe, or fatal COVID-19. With clinically tested inhibitors available, this study identifies sPLA2-IIA as a therapeutic target to reduce COVID-19 mortality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,360
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,645

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,360
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,224
Tête enseignante GPT0,510
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical InvestigationMême sujetCOVID-19 Clinical Research StudiesTravaux en français237 207