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Enregistrement W3195770897 · doi:10.1038/s41598-021-96474-6

NaV1.5 knockout in iPSCs: a novel approach to study NaV1.5 variants in a human cardiomyocyte environment

2021· article· en· W3195770897 sur OpenAlexafffund
Marion Pierre, Mohammed Djemai, Hugo Poulin, Mohamed Chahine

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInduced pluripotent stem cellReprogrammingNAV1Sodium channelSomatic cellPatch clampElectrophysiologyCell biologyKnockout mouseLong QT syndromeHEK 293 cellsTransfectionNav1.5Cell cultureBiologyNeuroscienceMolecular biologyMedicineChemistryInternal medicineQT intervalGeneticsCellGeneSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cardiomyocytes derived from patient-specific induced pluripotent stem cells (iPSC-CMs) successfully reproduce the mechanisms of several channelopathies. However, this approach involve cell reprogramming from somatic tissue biopsies or genomic editing in healthy iPSCs for every mutation found and to be investigated. We aim to knockout (KO) NaV1.5, the cardiac sodium channel, in a healthy human iPSC line, characterize the model and then, use it to express variants of NaV1.5. We develop a homozygous NaV1.5 KO iPSC line able to differentiate into cardiomyocytes with CRISPR/Cas9 tool. The NaV1.5 KO iPSC-CMs exhibited an organized contractile apparatus, spontaneous contractile activity, and electrophysiological recordings confirmed the major reduction in total Na+ currents. The action potentials (APs) exhibited a reduction in their amplitude and in their maximal rate of rise. Voltage optical mapping recordings revealed that the conduction velocity Ca2+ transient waves propagation velocities were slow. A wild-type (WT) NaV1.5 channel expressed by transient transfection in the KO iPSC-CMs restored Na+ channel expression and AP properties. The expression of NaV1.5/delQKP, a long QT type 3 (LQT3) variant, in the NaV1.5 KO iPSC-CMs showed that dysfunctional Na+ channels exhibited a persistent Na+ current and caused prolonged AP duration that led to arrhythmic events, characteristics of LQT3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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