NaV1.5 knockout in iPSCs: a novel approach to study NaV1.5 variants in a human cardiomyocyte environment
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cardiomyocytes derived from patient-specific induced pluripotent stem cells (iPSC-CMs) successfully reproduce the mechanisms of several channelopathies. However, this approach involve cell reprogramming from somatic tissue biopsies or genomic editing in healthy iPSCs for every mutation found and to be investigated. We aim to knockout (KO) NaV1.5, the cardiac sodium channel, in a healthy human iPSC line, characterize the model and then, use it to express variants of NaV1.5. We develop a homozygous NaV1.5 KO iPSC line able to differentiate into cardiomyocytes with CRISPR/Cas9 tool. The NaV1.5 KO iPSC-CMs exhibited an organized contractile apparatus, spontaneous contractile activity, and electrophysiological recordings confirmed the major reduction in total Na+ currents. The action potentials (APs) exhibited a reduction in their amplitude and in their maximal rate of rise. Voltage optical mapping recordings revealed that the conduction velocity Ca2+ transient waves propagation velocities were slow. A wild-type (WT) NaV1.5 channel expressed by transient transfection in the KO iPSC-CMs restored Na+ channel expression and AP properties. The expression of NaV1.5/delQKP, a long QT type 3 (LQT3) variant, in the NaV1.5 KO iPSC-CMs showed that dysfunctional Na+ channels exhibited a persistent Na+ current and caused prolonged AP duration that led to arrhythmic events, characteristics of LQT3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».