Identification of quantitative trait loci for fat percentage in buffaloes
Notice bibliographique
Résumé
The milk fat percentage records of 2174 daughters belonging to 12 half sib families were analyzed for the identification of QTLs on 8 chromosomes in buffaloes using chromosome scans. The single marker analysis revealed 49 markers to be associated with milk fat percentage in 10 sire families. The interval mapping using R/qtl identified 43 QTLs on 8 chromosomes of buffalo. The meta-QTL analysis was carried out to define consensus QTLs in buffaloes and total 28 meta-QTL regions could be identified for milk fat percentage. Most of the QTLs identified in the experiments have been reported for cattle; however, few new chromosomal locations were also identified to be associated with fat percentage in buffaloes. The additional QTLs identified in buffalo may be due to high level of heterozygosity in buffalo compared to Holstein Friesian and other exotic milk breeds for which QTLs have beenreported. Assuming buffalo-cattle synteny, a total of 1118 genes were identified underlying the QTL regions, out of these 45 genes were identified to be associated with lipid metabolism. The interaction among the genes and gene ontology analysis confirmed their association with lipid metabolism. These 45 genes have potential to be candidate genes for milk fat percentage in buffaloes and underlie the QTL regions identified in buffaloes in the present study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».