VirB4- and VirD4-like ATPases, components of a putative type 4C secretion system in <i>Clostridioides difficile</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The type 4 secretion system (T4SS) represents a bacterial nanomachine capable of trans-cell wall transportation of proteins and DNA and which has attracted intense interest due to its roles in the pathogenesis of infectious diseases. During the current investigation we uncovered three distinct gene clusters in Clostridioides difficile strain 630 coding for proteins structurally related to components of the VirB4/D4 type 4C secretion system from Streptococcus suis strain 05ZYH33 and located within sequences of conjugative transposons (CTn). Phylogenic analysis shows that VirB4- and VirD4-like proteins of CTn4 locus, on one hand, and those of CTn2 and CTn5 loci, on the other hand, fit into separate clades, suggesting specific roles of identified secretion system variants in physiology of C. difficile . Our further study on VirB4- and VirD4-like products coded by CTn4 revealed that both proteins possess Mg 2+ -dependent ATPase activity, form oligomers (most probably, hexamers) in water solutions, and rely on potassium but not sodium ions for the highest catalytic rate. VirD4 binds nonspecifically to DNA and RNA. Its DNA binding activity strongly decreased with the W241A variant. Mutations in the nucleotide sequences coding for presumable Walker A and Walker B motifs decreased stability of the oligomers and significantly but not completely attenuated enzymatic activity of VirB4. In VirD4, substitutions of amino acid residues in the peptides reminiscent of Walker structural motifs resulted neither in attenuation of enzymatic activity of the protein nor influenced the oligomerization state of the ATPase. Importance C. difficile is a Gram-positive, anaerobic, spore-forming bacterium that causes life-threatening colitis in humans. Major virulence factors of the microorganism include toxins TcdA, TcdB and CDT. However, other bacterial products, including a type 4C secretion system, have been hypothesized to contribute to the pathogenesis of the infection and are considered as possible virulence factors of C. difficile . In the current paper we describe structural organization of putative T4SS machinery in C. difficile and characterize its VirB4- and VirD4-like components. Our studies, in addition to significance for basic science, can potentially aid development of anti-virulence drugs suitable for treatment of C. difficile infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».