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Enregistrement W3196058546 · doi:10.3389/fcvm.2021.688396

Integration of Functional Imaging, Cytometry, and Unbiased Proteomics Reveals New Features of Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Ischemic Mitral Valve Regurgitation in Human Patients

2021· article· en· W3196058546 sur OpenAlexfundno aff
Adrien Lupieri, Yasufumi Nagata, Lívia Silva Araújo Passos, Dakota Beker-Greene, Katherine Kirkwood, Jill Wylie‐Sears, Zahra Alvandi, Hideyuki Higashi, Judy Hung, Sasha A. Singh, Joyce Bischoff, Robert A. Levine, Elena Aïkawa

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cardiovascular Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineProteomeFlow cytometryMyocardial infarctionPathologyCardiologyBioinformaticsBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Following myocardial infarction, mitral regurgitation (MR) is a common complication. Previous animal studies demonstrated the association of endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT) with mitral valve (MV) remodeling. Nevertheless, little is known about how MV tissue responds to ischemic heart changes in humans. Methods: MVs were obtained by the Cardiothoracic Surgical Trials Network from 17 patients with ischemic mitral regurgitation (IMR). Echo-doppler imaging assessed MV function at time of resection. Cryosections of MVs were analyzed using a multi-faceted histology and immunofluorescence examination of cell populations. MVs were further analyzed using unbiased label-free proteomics. Echo-Doppler imaging, histo-cytometry measures and proteomic analysis were then integrated. Results: MVs from patients with greater MR exhibited proteomic changes associated with proteolysis-, inflammatory- and oxidative stress-related processes compared to MVs with less MR. Cryosections of MVs from patients with IMR displayed activated valvular interstitial cells (aVICs) and double positive CD31+ αSMA+ cells, a hallmark of EndMT. Univariable and multivariable association with echocardiography measures revealed a positive correlation of MR severity with both cellular and geometric changes (e.g., aVICs, EndMT, leaflet thickness, leaflet tenting). Finally, proteomic changes associated with EndMT showed gene-ontology enrichment in vesicle-, inflammatory- and oxidative stress-related processes. This discovery approach indicated new candidate proteins associated with EndMT regulation in IMR. Conclusion: We describe an atypical cellular composition and distinctive proteome of human MVs from patients with IMR, which highlighted new candidate proteins implicated in EndMT-related processes, associated with maladaptive MV fibrotic remodeling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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