Cholinergic Synapse Pathway Gene Polymorphisms Associated With Late-Phase Responses in Allergic Rhinitis
Notice bibliographique
Résumé
Allergic rhinitis (AR) is characterized by an early-phase response (EPR), and in a subgroup of individuals, a late-phase response (LPR). We sought to investigate polymorphisms in cholinergic synapse pathway genes, previously associated with late-asthmatic responses, in the LPR. Twenty healthy participants and 74 participants with AR underwent allergen exposure using the Environmental Exposure Unit. Allergic participants were sub-phenotyped using self-reported nasal congestion scores; congestion is the predominant symptom experienced during the LPR. Acute congestion (AC, n = 36) participants developed only an EPR, while persistent congestion (PC, n = 38) participants developed both allergic responses. We interrogated blood samples collected before allergen exposure with genotyping and gene expression assays. Twenty-five SNPs located in ADCY3, AKT3, CACNA1S, CHRM3, CHRNB2, GNG4, and KCNQ4 had significantly different allele frequencies (P < 0.10) between PC and AC participants. PC participants had increased minor allele content (P = 0.009) in the 25 SNPs compared to AC participants. Two SNPs in AKT3 were associated with gene expression differences (FDR < 0.01) in PC participants. This study identified an association between the LPR and polymorphisms in the cholinergic synapse pathway genes, and developed a novel method to sub-phenotype AR using self-reported nasal congestion scores.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».