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Enregistrement W3196327362 · doi:10.3389/fphy.2021.726996

Polarization-Sensitive Second Harmonic Generation Microscopy for Investigations of Diseased Collagenous Tissues

2021· article· en· W3196327362 sur OpenAlexafffund
Richard Cisek, Ariana Joseph, MacAulay Harvey, Danielle Tokarz

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMicroscopyPathologyBiopsySecond-harmonic generationBiomedical engineeringPolarization MicroscopyExtracellular matrixMedicineMaterials scienceOpticsBiologyLaserPhysicsCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The advancement of non-invasive quantitative optical diagnosis techniques such as polarization-sensitive second harmonic generation microscopy (PSHG) for diseases such as cancer presents opportunities for improving disease understanding and survival rates. Here, novel and developing techniques in PSHG microscopy applied for the differentiation of cancerous or diseased tissues are presented, including circular dichroism, modulation of laser linear polarization, detection of outgoing linear laser polarization, and double-Stokes Mueller. Typically, initial cancer diagnosis is performed by visual inspection of stained biopsy or surgical resection tissue sections under bright-field microscopy, however, early diagnosis is challenging due to variability in morphological interpretation of the tissues, and because cancer initiation regions can be small and easy to miss. Therefore, pathologists could benefit in identifying cancer on biopsy or surgical resection sections by using unbiased quantitative automated technologies with high spatial resolution and improved disease specificity that can check the entire slide pixel-by-pixel. Second harmonic generation microscopy offers the opportunity to measure ultrastructural alterations in collagenous scaffolds of organ tissues virtually background free on submicron-sized tissue regions. The approach is particularly interesting for cancer diagnosis applications, because during cancer initiation and progression, the collagen in the affected tissue extracellular matrix is often deregulated and becomes disorganized. This mini-review contains a thorough summary of PSHG techniques that have interrogated diseased tissues, and discusses their technical variations and successes in disease discrimination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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