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Enregistrement W3196331341 · doi:10.62940/als.v8i3.1183

Reconnoitering Mycobacterium tuberculosis lipoproteins to design subunit vaccine by immunoinformatics approach

2021· article· en· W3196331341 sur OpenAlexfundno aff
Muhammad Ahsan Naeem, Muhammad Muzammal Adeel, Ayesha Kanwal, Sajjad Ahmad, Waqas Ahmad, Asif Saleh, Waqas Ahmed

Notice bibliographique

RevueAdvancements in Life Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHuazhong Agricultural UniversityYork University
Mots-clésMycobacterium tuberculosisMicrobiologyVirologyBiologyTuberculosisMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Tuberculosis is an aerosol transmitted disease of human beings caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The only available vaccine for Mtb is Bacillus Calmette-Guérin (BCG). Currently no alternative or booster is available for BCG. The objective of this predictive approach was based on binding of MHC-I and MHC-II and B cell epitopes of Mtb for mouse host.Methods: Immunoinformatics approach was used to design subunit vaccine (SV) by joining 8 MHC-I bindings, 6 MHC-II bindings, and 8 B-Cell epitopes with AAV, GPGPG, and KK amino acid linkers, respectively. The efficacy of the SV was enhanced through Mtb protein Rv3763 (LpqH, PDB ID= 4ZJM) as an adjuvant at the N-terminal of SV. The in silico analyses evaluated the SV to predict allergenicity, antigenicity, and physico-chemical properties.Results: Predictions revealed that SV is non-allergic and highly antigenic. The physico-chemical analysis showed that the SV was stable and basic in nature. The three-dimensional structure of SV was stable with a high binding affinity against the mouse TLR2 receptor. In silico cloning suggested the effective transformation of SV into the eukaryotic expression vector.Conclusion: This study permits preclinical validation of the designed SV in mouse host to confirm its immunogenic potential and efficacy, which will help in controlling tuberculosis.Keywords: Immunoinformatics; Docking; Subunit vaccine; Lipoprotein; Tuberculosis

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil0,812

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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