Reconnoitering Mycobacterium tuberculosis lipoproteins to design subunit vaccine by immunoinformatics approach
Notice bibliographique
Résumé
Background: Tuberculosis is an aerosol transmitted disease of human beings caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The only available vaccine for Mtb is Bacillus Calmette-Guérin (BCG). Currently no alternative or booster is available for BCG. The objective of this predictive approach was based on binding of MHC-I and MHC-II and B cell epitopes of Mtb for mouse host.Methods: Immunoinformatics approach was used to design subunit vaccine (SV) by joining 8 MHC-I bindings, 6 MHC-II bindings, and 8 B-Cell epitopes with AAV, GPGPG, and KK amino acid linkers, respectively. The efficacy of the SV was enhanced through Mtb protein Rv3763 (LpqH, PDB ID= 4ZJM) as an adjuvant at the N-terminal of SV. The in silico analyses evaluated the SV to predict allergenicity, antigenicity, and physico-chemical properties.Results: Predictions revealed that SV is non-allergic and highly antigenic. The physico-chemical analysis showed that the SV was stable and basic in nature. The three-dimensional structure of SV was stable with a high binding affinity against the mouse TLR2 receptor. In silico cloning suggested the effective transformation of SV into the eukaryotic expression vector.Conclusion: This study permits preclinical validation of the designed SV in mouse host to confirm its immunogenic potential and efficacy, which will help in controlling tuberculosis.Keywords: Immunoinformatics; Docking; Subunit vaccine; Lipoprotein; Tuberculosis
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».