MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3196396184 · doi:10.1017/s0033291721003767

Impact of data extraction errors in meta-analyses on the association between depression and peripheral inflammatory biomarkers: an umbrella review

2021· article· en· W3196396184 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuePsychological Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalDepartment of Psychiatry, University of TorontoKarolinska InstitutetNational Research Foundation of KoreaUniversity of TorontoUniversidade de São PauloUniversità degli Studi di PaviaNational Research Foundation
Mots-clésDepression (economics)Association (psychology)Data extractionPeripheralMEDLINEExtraction (chemistry)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Accumulating evidence suggests that alterations in inflammatory biomarkers are important in depression. However, previous meta-analyses disagree on these associations, and errors in data extraction may account for these discrepancies. Methods PubMed/MEDLINE, Embase, PsycINFO, and the Cochrane Library were searched from database inception to 14 January 2020. Meta-analyses of observational studies examining the association between depression and levels of tumor necrosis factor-α (TNF-α), interleukin 1-β (IL-1β), interleukin-6 (IL-6), and C-reactive protein (CRP) were eligible. Errors were classified as follows: incorrect sample sizes, incorrectly used standard deviation, incorrect participant inclusion, calculation error, or analysis with insufficient data. We determined their impact on the results after correction thereof. Results Errors were noted in 14 of the 15 meta-analyses included. Across 521 primary studies, 118 (22.6%) showed the following errors: incorrect sample sizes (20 studies, 16.9%), incorrect use of standard deviation (35 studies, 29.7%), incorrect participant inclusion (7 studies, 5.9%), calculation errors (33 studies, 28.0%), and analysis with insufficient data (23 studies, 19.5%). After correcting these errors, 11 (29.7%) out of 37 pooled effect sizes changed by a magnitude of more than 0.1, ranging from 0.11 to 1.15. The updated meta-analyses showed that elevated levels of TNF- α, IL-6, CRP, but not IL-1β, are associated with depression. Conclusions These findings show that data extraction errors in meta-analyses can impact findings. Efforts to reduce such errors are important in studies of the association between depression and peripheral inflammatory biomarkers, for which high heterogeneity and conflicting results have been continuously reported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,436
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,758
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,564
Score d'incertitude au seuil0,695

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,4360,758
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,006
Méta-épidémiologie (sens large)0,0170,030
Bibliométrie0,0220,029
Études des sciences et des technologies0,0030,006
Communication savante0,0090,008
Science ouverte0,0090,007
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,425
Tête enseignante GPT0,510
Écart entre enseignants0,085 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePsychological MedicineMême sujetTryptophan and brain disordersTravaux en français237 207