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Enregistrement W3196422877 · doi:10.1016/j.yrtph.2021.105029

Species selection for nonclinical safety assessment of drug candidates: Examples of current industry practice

2021· article· en· W3196422877 sur OpenAlexaff
Rostam Namdari, Keith Jones, Samuel S. Chuang, Steven Van Cruchten, Zuhal Dincer, Noel Downes, Lars Friis Mikkelsen, Joanna Harding, Sven Jäckel, Björn Jacobsen, Jacqueline Kinyamu-Akunda, Andréanne Lortie, Sofiene Mhedhbi, Susanne Mohr, Michael Schmitt, Helen Prior

Notice bibliographique

RevueRegulatory Toxicology and Pharmacology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensXenon Pharmaceuticals (Canada)
Organismes subventionnairesRoche
Mots-clésDocumentationProcess (computing)Drug developmentRisk analysis (engineering)Risk assessmentBusinessSelection (genetic algorithm)Similarity (geometry)Pharmaceutical industryBest practiceAnimal speciesDrugComputer scienceKnowledge managementBiotechnologyBiologyPharmacologyPolitical scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In drug development, nonclinical safety assessment is pivotal for human risk assessment and support of clinical development. Selecting the relevant/appropriate animal species for toxicity testing increases the likelihood of detecting potential effects in humans, and although recent regulatory guidelines state the need to justify or dis-qualify animal species for toxicity testing, individual companies have developed decision-processes most appropriate for their molecules, experience and 3Rs policies. These generally revolve around similarity of metabolic profiles between toxicology species/humans and relevant pharmacological activity in at least one species for New Chemical Entities (NCEs), whilst for large molecules (biologics) the key aspect is similarity/presence of the intended human target epitope. To explore current industry practice, a questionnaire was developed to capture relevant information around process, documentation and tools/factors used for species selection. Collated results from 14 companies (Contract Research Organisations and pharmaceutical companies) are presented, along with some case-examples or over-riding principles from individual companies. As the process and justification of species selection is expected to be a topic for continued emphasis, this information could be adapted towards a harmonized approach or best practice for industry consideration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,120
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,138
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1200,138
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,375 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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