MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3196793180 · doi:10.3390/jpm11090858

Identifying Clinicopathological Factors Associated with Oncotype DX® 21-Gene Recurrence Score: A Real-World Retrospective Cohort Study of Breast Cancer Patients in Quebec City, Canada

2021· article· en· W3196793180 sur OpenAlexafffundabout
Simon Gagnet, Caroline Diorio, Louise Provencher, Cynthia Mbuya-Bienge, Julie Lapointe, Claudya Morin, Julie Lemieux, Hermann Nabi

Notice bibliographique

RevueJournal of Personalized Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - Santé
Mots-clésMedicineBreast cancerInternal medicineRetrospective cohort studyCohortOncologyStage (stratigraphy)Logistic regressionCancerGynecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene expression profiling tests such as the Oncotype DX (ODX) 21-gene recurrence score (RS) assay is increasingly used in clinical practice to predict the risk of recurrence and support treatment planning for early-stage breast cancer (BC). However, this test has some disadvantages such as a high cost and a long turnaround time to get results, which may lead to disparities in access. We aim to identify clinicopathological factors associated with ODX RS in women with early-stage BC. We conducted a retrospective cohort study of women identified in the medical database of the Deschênes-Fabia Breast Disease Center of Quebec City University, Canada. Our sample consists of 425 women diagnosed with early-stage BC who have obtained an ODX RS between January 2011 and April 2015. The ODX RS has been categorized into three levels as originally defined: low (0-17), intermediate (18-30), and high (>30). The mean RS was 17.8 (SD = 9.2). Univariate analyses and multinomial logistic regressions were performed to identify factors associated with intermediate and high RS compared with low RS. A total of 237 (55.8%) patients had low RS, 148 (34.8%) had intermediate RS, and 40 (9.4%) had high RS. Women with progesterone receptor (PR)-negative (ORs ranging from 3.51 to 10.34) and histologic grade II (ORs ranging from 3.16 to 23.04) tumors were consistently more likely to have intermediate or high RS than low RS. Similar patterns of associations were observed when the RS was categorised using redefined thresholds from (i.e., from the TAILORx study or dichotomized). This study provides evidence suggesting that histologic grade and PR status are predictive factors for intermediate or high RS in women with early-stage BC. If these results are confirmed in future studies, considering these clinicopathological factors could spare women the need to get such a test before the beginning of a possible adjuvant therapy. This option could be considered in settings where the cost of testing is an issue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil0,604

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Personalized MedicineMême sujetBreast Cancer Treatment StudiesTravaux en français237 207