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Enregistrement W3197025432 · doi:10.1088/2516-1075/ac22b8

Performance of small basis set Hartree–Fock methods for modeling non-covalent interactions

2021· article· en· W3197025432 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueElectronic Structure · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan Campus
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinisterio de Ciencia e InnovaciónWestern Canada Research GridCompute Canada
Mots-clésBasis (linear algebra)Hartree–Fock methodSet (abstract data type)Basis setCovalent bondChemistryBiological systemStatistical physicsComputer scienceComputational chemistryMathematicsPhysicsBiologyDensity functional theoryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Non-covalent interactions (NCIs) play an essential role in (bio)chemistry. Wavefunction-based methods combined with large basis sets are able to accurately describe inter-and intra-molecular NCIs but are not practical for large molecular systems. Semi-empirical corrections have been developed recently that, when combined with Hartree–Fock (HF) and a small basis set, show promise in the ability to predict non-covalent binding and conformational energies over a wide range of systems. Compared to large-basis-set correlated wavefunction methods, small-basis-set HF methods significantly lower computational cost and are useful for modeling large molecular systems with sizes between many hundreds and a few thousand atoms. Using a large collection of non-covalent binding energies, conformational energies, and molecular deformation energies containing 105 880 entries, we provide a comprehensive evaluation of the performance of the minimal basis set (MINIX) HF method with three correction schemes: D3, 3c, and atom-centered potentials (ACPs). We also evaluate the performance of HF/6-31G* in combination with the D3 and ACP schemes. By comparing the three corrections, we analyze the strengths and weaknesses associated with each strategy in predicting NCIs. Our results show that D3 corrections alone do not offer significant improvements in the performance of HF/MINIX or HF/6-31G* and, in some cases, overestimate binding energies resulting in large errors when compared to the reference data. The correction strategies that offer the best reduction in the underlying errors of HF/MINIX and HF/6-31G* are shown to be 3c and ACP for HF/MINIX and ACP for HF/6-31G*.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,319
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle