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Enregistrement W3197195319 · doi:10.1002/jbio.202100203

Spectral photokinetic conversion of the fluorescent probes BSB and K114 for improved detection of amyloid assemblies

2021· article· en· W3197195319 sur OpenAlexafffund
Anastasiia A. Stepanchuk, Jeffrey T. Joseph, Peter K. Stys

Notice bibliographique

RevueJournal of Biophotonics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiquePhotochromic and Fluorescence Chemistry
Établissements canadiensAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsCanada Foundation for InnovationAlzheimer's Drug Discovery Foundation
Mots-clésAmyloid (mycology)FluorescenceBiophysicsFibrilAmyloid fibrilChemistryProtein aggregationKineticsAmyloidosisBiochemistryAmyloid βPathologyBiologyDiseaseMedicineOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cross-β-sheet-rich protein fibrils are infamous for their accumulation in the brains of patients diagnosed with a number of neurodegenerative diseases, including Alzheimer's disease (AD). Disease-relevant fibrils are a result of deviation of the proteins from their native structure to a misfolded state resulting in aggregation and formation of fibrils. In this study, we explored the phenomenon of light-induced fluorescence enhancement of amyloid assemblies stained with two amyloid probes (BSB and K114) using Bombyx mori silk and human AD brain sections. The photoconversion effect, accompanied by an increase in fluorescence intensity and spectral blue-shift, was highly dependent on the chemical structures of the dyes, pH, presence of glycerol and the type of amyloid. The degree of intensity and spectral change over time in response to high laser exposure were quantified and analyzed using custom-written analysis tools. Our findings provide further insight into possible mechanisms of amyloid-mediated photoconversion kinetics of K114 and BSB, and may provide more insight into the molecular nature of various amyloid assemblies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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