MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3197351282 · doi:10.1002/mrm.29000

A data‐driven T<sub>2</sub> relaxation analysis approach for myelin water imaging: Spectrum analysis for multiple exponentials via experimental condition oriented simulation (SAME‐ECOS)

2021· article· en· W3197351282 sur OpenAlexafffund
Hanwen Liu, Tigris Joseph, Qing‐San Xiang, Roger Tam, Piotr Kozłowski, David K.B. Li, Alex L. MacKay, John L. K. Kramer, Cornelia Laule

Notice bibliographique

RevueMagnetic Resonance in Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMultiple Sclerosis Society of Canada
Mots-clésExponential functionComputer scienceInitializationRelaxation (psychology)AlgorithmMathematicsMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose The decomposition of multi‐exponential decay data into a T2 spectrum poses substantial challenges for conventional fitting algorithms, including non‐negative least squares (NNLS). Based on a combination of the resolution limit constraint and machine learning neural network algorithm, a data‐driven and highly tailorable analysis method named spectrum analysis for multiple exponentials via experimental condition oriented simulation (SAME‐ECOS) was proposed. Theory and Methods The theory of SAME‐ECOS was derived. Then, a paradigm was presented to demonstrate the SAME‐ECOS workflow, consisting of a series of calculation, simulation, and model training operations. The performance of the trained SAME‐ECOS model was evaluated using simulations and six in vivo brain datasets. The code is available at https://github.com/hanwencat/SAME‐ECOS . Results Using NNLS as the baseline, SAME‐ECOS achieved over 15% higher overall cosine similarity scores in producing the T2 spectrum, and more than 10% lower mean absolute error in calculating the myelin water fraction (MWF), as well as demonstrated better robustness to noise in the simulation tests. Applying to in vivo data, MWF from SAME‐ECOS and NNLS was highly correlated among all study participants. However, a distinct separation of the myelin water peak and the intra/extra‐cellular water peak was only observed in the mean T2 spectra determined using SAME‐ECOS. In terms of data processing speed, SAME‐ECOS is approximately 30 times faster than NNLS, achieving a whole‐brain analysis in 3 min. Conclusion Compared with NNLS, the SAME‐ECOS method yields much more reliable T2 spectra in a dramatically shorter time, increasing the feasibility of multi‐component T2 decay analysis in clinical settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMagnetic Resonance in MedicineMême sujetAdvanced MRI Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207