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Enregistrement W3197532661 · doi:10.5812/gct.115993

Role of DYSF Genetic Variant in Limb Girdle Muscular Dystrophy: A Case Report

2021· article· en· W3197532661 sur OpenAlexaff
Hadis Malek, Khadijeh Shahrokhabadi, Saeid Ghavami, Mohsen Taheri, Ehsan Ghayoor Karimiani

Notice bibliographique

RevueGene Cell and Tissue · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProbandLimb-girdle muscular dystrophyMuscular dystrophyExome sequencingGeneticsSanger sequencingGenetic counselingMedicineBiologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Muscular dystrophy is a hereditary degenerative muscle disease which progressively reduces the strength of the muscles that control movement. In this study, we tried to investigate genetic variants in muscular dystrophy using sequencing of whole exons. Case Presentation: A family with two affected patients with muscular dystrophy was referred for genetic counseling followed by exome sequencing testing on the proband. After filling out informed consent, blood samples were obtained from each available family member. Candidate genetic variant was confirmed using Sanger sequencing. Conclusions: Exome data analysis revealed a variant of c.2864 + 1G > A in the proband, which altered the exon-intron 26 splice site within the DYSF gene. Genetic changes in this gene are known to be associated with muscular disorders, such as limb-girdle muscular dystrophy and other dysferlinopathies. Assessment of this genetic variant in the patient's sister also showed homozygous variant. Since the patient's sister was married to her cousin, the same variant was tested in her husband, which was normal homozygous. NGS-based techniques, including whole-exome sequencing, can identify the molecular genetic basis of the disease in families with limb-girdle muscular dystrophy. The results can be helpful in identifying potential carriers in the family and in prenatal diagnosis to the families involved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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