Characterization of Histone Lysine β-hydroxybutyrylation in bovine tissues, cells, and cumulus-oocyte complexes
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Besides their canonical roles as energy sources, short-chain fatty acids act as metabolic regulators of gene expression through the histone post-translational modifications. The ketone body β-hydroxybutyrate (BHB) was shown to cause a novel type of epigenetic modification, Histone Lysine β-hydroxybutyrylation (Kbhb), associated with genes upregulated in starvation-responsive metabolic pathways. Dairy cows increase BHB in early lactation and its effects on cellular epigenome are largely unknown. To unravel these effects, we sought and identified that Kbhb is present in bovine tissues in vivo and further confirmed that this epigenetic mark is responsive to BHB in bovine and human fibroblasts cultured in vitro in a dose-dependent manner. We also demonstrated that the maturation of cumulus-oocyte complexes with high concentrations of BHB did not affect the competence to complete meiotic maturation neither to develop until blastocyst stage. BHB treatment strongly induced H3K9bhb in cumulus cells, but this modification was only faintly detected in oocytes. Profiling the transcriptome in cumulus cells indicated that BHB treatment altered the expression of 345 genes. The down-regulated genes are mainly involved in glycolysis and ribosome assembly pathways, while the up-regulated genes are involved in mitochondrial metabolism and oocyte development. The specific genes and pathways altered by BHB treatment will provide entry points to carry out functional experiments aiming to mitigate problems and improve fertility in cattle suffering metabolic disorders. A key goal for future work will be to understand mechanistically how BHB transmits signals from the environment to affect cellular functions and the bovine epigenome. Summary sentence Beta-hydroxybutyrate induces Histone Lysine β-hydroxybutyrylation in fibroblasts and cumulus-oocyte complexes, it alters the transcriptome in cumulus cells, but does not affect oocyte’s competence to resume meiosis and develop until blastocyst stage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».