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Enregistrement W3197717323 · doi:10.1021/acsptsci.1c00157

Identification of Key Regions Mediating Human Melatonin Type 1 Receptor Functional Selectivity Revealed by Natural Variants

2021· article· en· W3197717323 sur OpenAlexafffund
Alan Hégron, Eunna Huh, Xavier Deupí, Badr Sokrat, Wenwen Gao, Christian Le Gouill, Mickaël Canouil, Mathilde Boissel, G. Charpentier, Ronan Roussel, Beverley Balkau, Philippe Froguel, Bianca Plouffe, Amélie Bonnefond, Olivier Lichtarge, Ralf Jockers, Michel Bouvier

Notice bibliographique

RevueACS Pharmacology & Translational Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesFonds de Recherche du Québec - SantéChina Scholarship CouncilInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Institutes of HealthCanada Research ChairsWellcome TrustAgence Nationale de la RechercheUniversité de MontréalDiabetes UKDiabetes CanadaCentre National de la Recherche ScientifiqueCanadian Institutes of Health ResearchWellcome
Mots-clésIdentification (biology)Melatonin receptorKey (lock)MelatoninComputational biologyReceptorBiologyNeuroscienceGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Melatonin is a hormone mainly produced by the pineal gland and MT 1 is one of the two G protein-coupled receptors (GPCRs) mediating its action. Despite an increasing number of available GPCR crystal structures, the molecular mechanism of activation of a large number of receptors, including MT 1, remains poorly understood. The purpose of this study is to elucidate the structural elements involved in the process of MT 1 ’s activation using naturally occurring variants affecting its function. Thirty-six nonsynonymous variants, including 34 rare ones, were identified in MTNR1A (encoding MT 1 ) from a cohort of 8687 individuals and their signaling profiles were characterized using Bioluminescence Resonance Energy Transfer-based sensors probing 11 different signaling pathways. Computational analysis of the experimental data allowed us to group the variants in clusters according to their signaling profiles and to analyze the position of each variant in the context of the three-dimensional structure of MT 1 to link functional selectivity to structure. MT 1 variant signaling profiles revealed three clusters characterized by (1) wild-type-like variants, (2) variants with selective defect of βarrestin-2 recruitment, and (3) severely defective variants on all pathways. Our structural analysis allows us to identify important regions for βarrestin-2 recruitment as well as for Gα12 and Gα15 activation. In addition to identifying MT 1 domains differentially controlling the activation of the various signaling effectors, this study illustrates how natural variants can be used as tools to study the molecular mechanisms of receptor activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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