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Enregistrement W3197822718 · doi:10.3389/fmars.2021.716124

Contrasting Proteomic Responses of Adult and Larval Coral to High Temperatures

2021· article· en· W3197822718 sur OpenAlexaff
Crystal J. McRae, Anderson B. Mayfield, Wen‐Bin Huang, Isabelle M. Côté, Tung‐Yung Fan

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueCoral and Marine Ecosystems Studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Technology, Taiwan
Mots-clésCoralBiologyHolobiontDinoflagellateEcologyAnthozoaLarvaSymbiodiniumProteomeStylophora pistillataCoral reefEcosystemSymbiosisBioinformaticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Climate change-induced increases in seawater temperature continue to impact coral reef ecosystems globally. There is a consequent need to characterize the responses of corals to thermal stress to understand the molecular processes underpinning these responses and identify hallmarks of resilience. Here we used an iTRAQ approach to compare the proteomes of adult corals (Pocillopora acuta) that had been thermally conditioned at a control (26°C) or elevated temperature (29.5°C) for three reproductive cycles, as well as the larvae released by these corals. We found that larvae responded more to high-temperature exposure at the protein level than their parents and that different proteins were affected between life stages; a single protein was up-regulated at high temperatures in both adults and their offspring, and its identity is currently unknown. Similarly, different cellular pathways were affected by high-temperature exposure between the coral hosts and their dinoflagellate endosymbionts; proteins involved in translation and protein trafficking were most likely to be affected by high-temperature exposure in the former, with photosynthesis being the most thermo-sensitive process in the latter. Collectively, these findings highlight the importance of considering both life stage and the composition of the coral holobiont when using molecular-scale data to model cellular processes associated with responses to future ocean warming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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