Validation of Non-photochemical Quenching Corrections for Chlorophyll-a Measurements Aboard Ships of Opportunity
Notice bibliographique
Résumé
The in vivo fluorescence of chlorophyll-a is commonly used as a proxy for phytoplankton biomass. Measurement of in vivo fluorescence in the field is attractive because it can be made at high spatial temporal, and vertical resolution relative to discrete sampling and pigment extraction. Fluorometers installed on ships of opportunity provide a cost-effective alternative to many of the traditional sampling methods. However, fluorescence-based estimates of chlorophyll-a can be impacted by sensor calibration and biofouling, variations in phytoplankton taxonomy and physiology (such as non-photochemical quenching) and the influence of other fluorescing matters in the water. Several methods have been proposed to address these issues separately, but few studies have addressed the interaction of multiple sources of error in the in vivo Chl-a fluorescence signal. Here, we demonstrate a method to improve the accuracy of chlorophyll-a concentration retrieved from a coastal ferry system, operating in a dynamic estuarine system. First, we used HPLC chlorophyll-a measurements acquired in low-light conditions to correct sensor level bias. Next, we tested three methods to correct the effect of non-photochemical quenching and evaluated the accuracy of each method using HPLC. As our study area is in highly dynamic coastal waters, we also evaluated the accuracy of our correction procedure across a range of irradiance and biogeochemical conditions. We found that sensor bias accounted for a significant portion of error in the fluorescence signal. The NPQ correction developed by Davis et al. (2008) best improved correspondence between in vivo Chl-a fluorescence and HPLC-based measurement of extracted Chl-a. We suggest the use of this correction for in vivo Chl-a measurements along with pre-processing steps to correct potential sensor biofouling and bias.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».