Abstract MP60: Down-regulated Mir-338-3p In Subcutaneous Small Arteries Of Hypertensive Patients With Chronic Kidney Disease Targets Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type S And Glutathione Peroxidase 3
Notice bibliographique
Résumé
Background: Hypertension (HTN) causes vascular injury identified by endothelial dysfunction, vascular stiffening, and remodeling, which contributes to kidney damage leading to chronic kidney disease (CKD). MicroRNAs (miRNAs) repress/degrade target mRNAs. Their role in vascular injury in HTN remains unclear. We aimed to identify differentially expressed (DE) miRNAs in gluteal subcutaneous arteries of patients with HTN associated or not with CKD to shed light on the pathophysiological molecular mechanisms. Methods: Normotensive subjects and patients with HTN associated or not with CKD grades 3-4 were studied (n=15-16). Small arteries were isolated from gluteal subcutaneous biopsies, RNA extracted and small and total RNA sequencing performed by Illumina HiSeq-2500. DE genes were identified with a P <0.05 and fold change (FC) >1.3. Top 3 DE miRNAs ( P <0.001, FC>2, mean read count number (MRCN) >3,000 in all groups and having predicted mRNA targets) were selected for validation by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). The mRNA targets of the top selected miRNA were predicted by TargetScan with P <0.01, FC>1.5 and MRCN>150 and the top 9 targets were validated by RT-qPCR using gain- and loss-of-function in human aortic endothelial cells (HAECs). Gene ontology enrichment analysis (GOEA) was done in Cytoscape. Results: DE miRNAs and mRNAs were identified uniquely associated with HTN (miRNAs: 10, mRNAs: 68), CKD (miRNAs: 68, mRNAs: 395), and in both groups (miRNAs: 2, mRNAs: 32). miR-338-3p presented the best correlation between RNA sequencing and RT-qPCR (R 2 =0.328, P <0.001) among the top 3 DE miRNAs. Two of the selected top 9 miR-338-3p predicted targets were validated in HAECs. Protein tyrosine phosphatase receptor type S ( PTPRS , FC: 0.80±0.08 vs 1.00±0.00) and glutathione peroxidase 3 ( GPX3 , FC: 0.88±0.04 vs 1.00±0.00) were down-regulated in HAECs transfected with miR-338-3p mimics ( P <0.05). GOEA showed association of GPX3 with oxidative stress detoxification ( q <0.05), and of PTPRS with the immune system, neuronal system and developmental process ( q <0.001). Conclusion: Down-regulated miR-338-3p in gluteal subcutaneous small arteries of hypertensive patients with CKD targets PTPRS and GPX3 that may play a role in vascular injury in HTN.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».