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Enregistrement W3198380865 · doi:10.21203/rs.3.rs-847329/v1

Epigenetic Marker of Telomeric Age is Associated with Exacerbations and Hospitalizations in Chronic Obstructive Pulmonary Disease

2021· preprint· en· W3198380865 sur OpenAlexafffund
Ana I. Hernández Cordero, Chen Xi Yang, Xuan Li, Stephen Milne, Virginia Chen, Zsuzsanna Hollander, Raymond T. Ng, Gerard J. Criner, Prescott G. Woodruff, Stephen C. Lazarus, John E. Connett, MeiLan K. Han, Fernando J. Martínez, Robert M. Reed, S. F. Paul Man, Janice M. Leung, Don D. Sin

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaMitacsSt. Paul's FoundationAstraZeneca
Mots-clésMedicineCOPDExacerbationBiomarkerInternal medicineDNA methylationBody mass indexOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is an age-related condition that has been associated with early telomere attrition; the clinical implications of telomere shortening in COPD are not well known. In this study we aimed to determine the relationship of the epigenetic regulation of telomeric length in peripheral blood with the risk of exacerbations and hospitalization in patients with COPD. Methods: Blood DNA methylation profiles were obtained from 292 patients with COPD enrolled in the placebo arm of the Macrolide Azithromycin to Prevent Rapid Worsening of Symptoms Associated With Chronic Obstructive Pulmonary Disease study (MACRO) and who were followed for 1-year. We calculated telomere length based on DNA methylation markers (DNAmTL) and related this biomarker to the risk of exacerbation and hospitalization and health status (St. George respiratory questionary score [SGRQ]) over this time using a Cox proportional hazards model. We also used linear models to investigate the associations of DNAmTL with the rates of exacerbations and hospitalizations (adjusted for chronological age, lung function, race, sex, smoking, and body mass index).Results: Participants with short DNAmTL demonstrated increased risk of exacerbation (P=0.02) and hospitalization (P=0.03) compared to those with longer DNAmTL. DNAmTL age acceleration was associated with higher rates of exacerbation (P=1.35x10-04) and hospitalization (P=5.21x10-03) and poor health status (SGRQ) independent of chronological age (P=0.03).Conclusion: Telomeric age based on blood DNA methylation is associated with COPD exacerbation and hospitalization and thus is a promising biomarker for poor outcomes in COPD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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