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Enregistrement W3198528154 · doi:10.1016/j.tcsw.2021.100061

Glucan and glycogen exist as a covalently linked macromolecular complex in the cell wall of Candida albicans and other Candida species

2021· article· en· W3198528154 sur OpenAlexaff
Douglas W. Lowman, M. Sameer Al‐Abdul‐Wahid, Zuchao Ma, Michael Kruppa, Elena Rustchenko, David L. Williams

Notice bibliographique

RevueThe Cell Surface · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésGlucanGlycogenCandida albicansBiochemistryPolysaccharideCell wallMannanCorpus albicansGlycogen branching enzymeBiologyChemistryGlycogen synthaseMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungal cell wall serves as the interface between the organism and its environment. Complex carbohydrates are a major component of the Candida albicans cell wall, i.e., glucan, mannan and chitin. β-Glucan is a pathogen associated molecular pattern (PAMP) composed of β-(1 → 3,1 → 6)-linked glucopyranosyl repeat units. This PAMP plays a key role in fungal structural integrity and immune recognition. Glycogen is an α-(1 → 4,1 → 6)-linked glucan that is an intracellular energy storage carbohydrate. We observed that glycogen was co-extracted during the isolation of β-glucan from C. albicans SC5314. We hypothesized that glucan and glycogen may form a macromolecular species that links intracellular glycogen with cell wall β-(1 → 3,1 → 6)-glucan. To test this hypothesis, we examined glucan-glycogen extracts by multi-dimensional NMR to ascertain if glycogen and β-glucan were interconnected. 1H NMR analyses confirmed the presence of glycogen and β-glucan in the macromolecule. Diffusion Ordered SpectroscopY (DOSY) confirmed that the β-glucan and glycogen co-diffuse, which indicates a linkage between the two polymers. We determined that the linkage is not via peptides and/or small proteins. Our data indicate that glycogen is covalently linked to β-(1 → 3,1 → 6) glucan via the β -(1 → 6)-linked side chain. We also found that the glucan-glycogen complex was present in C. dublinensis, C. haemulonii and C. auris, but was not present in C. glabrata or C. albicans hyphal glucan. These data demonstrate that glucan and glycogen form a novel macromolecular complex in the cell wall of C. albicans and other Candida species. This new and unique structure expands our understanding of the cell wall in Candida species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,472
Score d'incertitude au seuil0,804

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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