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Enregistrement W3198606347 · doi:10.26685/urncst.259

Why is Yeast Such a Widely Used Eukaryotic Model Organism? A Literature Review

2021· review· en· W3198606347 sur OpenAlexaff
Dusan Pesic

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésModel organismYeastSchizosaccharomyces pombeOrganismSaccharomyces cerevisiaeBiologyGenomeComputational biologySchizosaccharomycesGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The use of yeasts in various fields dates back to thousands of years ago, but their biological significance has only recently been discovered. Genomes of many members of this relatively small group have been sequenced, and the consequent studies on them and on various cell processes have revealed similarities between yeast species Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe, and other eukaryotes, suggesting that they may be used as eukaryotic model organisms. Methods: A literature search was conducted investigating general yeast characteristics, genetics and physiology, as well as modern applications in biomedical research as model organisms. Results: Yeasts have many traits that make them especially favorable in research: they can easily be cultivated in laboratory conditions where their metabolism may be altered by tweaking the growth medium properties. Additionally, analyzing the yeast and human genome sequences has revealed astonishing similarities, with many successfully mapped homologous genes. Discussion: By varying environmental conditions of a S. cerevisiae culture, it was found that such treatments could affect respiration in yeast. Proving useful in research of antifungal drugs and interactions between fungal pathogens and hosts, yeast was also used as a model for studying prion related diseases, Alzheimer’s disease and cancer, amongst others. Conclusion: With all the yeast characteristics—their simple requirements for growth, their genome and metabolism similar to other eukaryotes, and their use in studying varying disease conditions—it is understandable and clear why yeasts are such widely used model organisms. Considering recent advancements, their application in biomedical research will inevitably increase over time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,008
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,363 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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