Combating Antimicrobial Resistance: Assessing Efflux Pump Deficient Environments in Neisseria gonorrhoeae and the Masking Effect on Antimicrobial-Resistant Mutations
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Antimicrobial resistance (AMR) is a global emergency that involves the process of microbes gaining resistance to antimicrobials. A specific example of this is Neisseria (N.) gonorrhoeae gaining resistance to azithromycin, which can be caused by mutations at ribosomal sites. New research suggests that manipulating the bacteria to create a drug efflux pump deficiency will “mask” the effects of AMR mutations when introduced to antibiotic drugs, compared to that of a drug efflux pump proficient environment. This proposal aims to investigate the effects of a drug efflux pump deficient environment compared to a proficient environment on azithromycin drug efficacy in N. gonorrhoeae with an AMR ribosomal mutation. It is hypothesized that AMR mutations can be masked through gene knockout causing MtrCDE efflux pump deficient environments of N. gonorrhoeae. Methods: Aim 1 consists of inducing a ribosomal mutation that incurs resistance to azithromycin in N. gonorrhoeae strains using CRISPR genome editing in groups A and B. Aim 2 will utilize CRISPR-Cas9 to delete the mtrE gene in N. gonorrhoeae, rendering the MtrCDE efflux pump deficient, creating an efflux pump deficient environment in the bacteria of groups B and D. Aim 3 will determine the difference in susceptibility of N. gonorrhoeae towards azithromycin between efflux pump deficient and proficient environments, using disk diffusion and zone of inhibition. Results: We expect Group A will have a smaller diameter zone of inhibition exhibiting azithromycin resistance, while Groups B, C and D will result in a larger diameter exhibiting azithromycin susceptibility. Discussion: We anticipate that Group A will have the smallest diameter zone of inhibition due to the azithromycin resistant mutation and proficient efflux pump environment. We expect Group B will have the largest diameter, demonstrating that N. gonorrhoeae became susceptible to azithromycin with the deficient efflux pump environment masking the azithromycin resistant mutation. Group C (proficient pump) and D (deficient pump) are both wild-type strains therefore we predict they will have larger diameters due to their natural susceptibility to azithromycin. Conclusion: The proposed experiment could help uncover the molecular mechanisms behind masking, which could consequently provide a gateway towards effective strategies to combat AMR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».