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Enregistrement W3198803853 · doi:10.1002/pmic.202100160

SGLT2‐Inhibition reverts urinary peptide changes associated with severe COVID‐19: An in‐silico proof‐of‐principle of proteomics‐based drug repurposing

2021· article· en· W3198803853 sur OpenAlexaff
Agnieszka Latosińska, Justyna Siwy, David Z.I. Cherney, Bruce A. Perkins, Harald Mischak, Joachim Beige

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug repositioningRepurposingContext (archaeology)EmpagliflozinCoronavirus disease 2019 (COVID-19)DrugMedicinePharmacologyUrinary systemInternal medicineBiologyDiabetes mellitusInfectious disease (medical specialty)DiseaseType 2 diabetes

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe COVID-19 is reflected by significant changes in urine peptides. Based on this observation, a clinical test predicting COVID-19 severity, CoV50, was developed and registered as in vitro diagnostic in Germany. We have hypothesized that molecular changes displayed by CoV50, likely reflective of endothelial damage, may be reversed by specific drugs. Such an impact by a drug could indicate potential benefits in the context of COVID-19. To test this hypothesis, urinary peptide data from patients without COVID-19 prior to and after drug treatment were collected from the human urinary proteome database. The drugs chosen were selected based on availability of sufficient number of participants in the dataset (n > 20) and potential value of drug therapies in the treatment of COVID-19 based on reports in the literature. In these participants without COVID-19, spironolactone did not demonstrate a significant impact on CoV50 scoring. Empagliflozin treatment resulted in a significant change in CoV50 scoring, indicative of a potential therapeutic benefit. The study serves as a proof-of-principle for a drug repurposing approach based on human urinary peptide signatures. The results support the initiation of a randomized control trial testing a potential positive effect of empagliflozin for severe COVID-19, possibly via endothelial protective mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,375
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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