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Enregistrement W3199086925 · doi:10.1016/j.jcmgh.2021.08.001

The Circadian Clock Gene, Bmal1, Regulates Intestinal Stem Cell Signaling and Represses Tumor Initiation

2021· article· en· W3199086925 sur OpenAlexafffund
Kyle Stokes, Malika Nunes, Chantelle Trombley, Danilo E. F. L. Flôres, Gang Wu, Zainab Taleb, Abedalrhman Alkhateeb, Suhrid Banskota, Chris Harris, Oliver P. Love, Waliul I. Khan, Luis Rueda, John B. Hogenesch, Phillip Karpowicz

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthOntario Institute for Regenerative MedicineCrohn's and Colitis CanadaNational Heart, Lung, and Blood InstituteFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCanadian Institutes of Health ResearchMitacsCanada Research Chairs
Mots-clésCircadian rhythmCircadian clockBiologyCell biologyStem cellGeneCancer researchGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The loss of circadian rhythms in the intestine leads to aberrant regulation of stem cell signaling pathways and increased tumor initiation. BACKGROUND & AIMS:Circadian rhythms are daily physiological oscillations driven by the circadian clock: a 24-hour transcriptional timekeeper that regulates hormones, inflammation, and metabolism.Circadian rhythms are known to be important for health, but whether their loss contributes to colorectal cancer is not known.We tested the nonredundant clock gene Bmal1 in intestinal homeostasis and tumorigenesis, using the Apc min model of colorectal cancer.METHODS: Bmal1 mutant, epithelium-conditional Bmal1 mutant, and photoperiod (day/night cycle) disrupted mice bearing the Apc min allele were assessed for tumorigenesis.Tumors and normal nontransformed tissue were characterized.Intestinal organoids were assessed for circadian transcription rhythms by RNA sequencing, and in vivo and organoid assays were used to test Bmal1-dependent proliferation and selfrenewal.RESULTS: Loss of Bmal1 or circadian photoperiod increases tumor initiation.In the intestinal epithelium the clock regulates transcripts involved in regeneration and intestinal stem cell signaling.Tumors have no self-autonomous clock function and only weak clock function in vivo.Apc min clock-disrupted tumors show high Yes-associated protein 1 (Hippo signaling) activity but show low Wnt (Wingless and Int-1) activity.Intestinal organoid assays show that loss of Bmal1 increases self-renewal in a Yes-associated protein 1-dependent manner.CONCLUSIONS: Bmal1 regulates intestinal stem cell pathways, including Hippo signaling, and the loss of circadian rhythms potentiates tumor initiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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