MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3199106116 · doi:10.1007/s00248-021-01932-3

Bio-fertilizer Affects Structural Dynamics, Function, and Network Patterns of the Sugarcane Rhizospheric Microbiota

2021· article· en· W3199106116 sur OpenAlexaff
Qiang Liu, Ziqin Pang, Zuli Yang, Nyumah Fallah, Chaohua Hu, Wenxiong Lin, Zhaonian Yuan

Notice bibliographique

RevueMicrobial Ecology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesModern Agricultural Technology Industry System of Shandong provinceFujian Agriculture and Forestry UniversityNatural Science Foundation of Fujian Province
Mots-clésFertilizerAgronomyBiologyRhizosphereSoil pHBiofertilizerSoil waterEcologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fertilizers and microbial communities that determine fertilizer efficiency are key to sustainable agricultural development. Sugarcane is an important sugar cash crop in China, and using bio-fertilizers is important for the sustainable development of China's sugar industry. However, information on the effects of bio-fertilizers on sugarcane soil microbiota has rarely been studied. In this study, the effects of bio-fertilizer application on rhizosphere soil physicochemical indicators, microbial community composition, function, and network patterns of sugarcane were discussed using a high-throughput sequencing approach. The experimental design is as follows: CK: urea application (57 kg/ha), CF: compound fertilizer (450 kg/ha), BF1: bio-fertilizer (1500 kg/ha of bio-fertilizer + 57 kg/ha of urea), and BF2: bio-fertilizer (2250 kg/ha of bio-fertilizer + 57 kg/ha of urea). The results showed that the bio-fertilizer was effective in increasing sugarcane yield by 3-12% compared to the CF treatment group, while reducing soil acidification, changing the diversity of fungi and bacteria, and greatly altering the composition and structure of the inter-root microbial community. Variance partitioning canonical correspondence (VPA) analysis showed that soil physicochemical variables explained 80.09% and 73.31% of the variation in bacteria and fungi, respectively. Redundancy analysis and correlation heatmap showed that soil pH, total nitrogen, and available potassium were the main factors influencing bacterial community composition, while total soil phosphorus, available phosphorus, pH, and available nitrogen were the main drivers of fungal communities. Volcano plots showed that using bio-fertilizers contributed to the accumulation of more beneficial bacteria in the sugarcane rhizosphere level and the decline of pathogenic bacteria (e.g., Leifsonia), which may slow down or suppress the occurrence of diseases. Linear discriminant analysis (LDA) and effect size analysis (LEfSe) searched for biomarkers under different fertilizer treatments. Meanwhile, support vector machine (SVM) assessed the importance of the microbial genera contributing to the variability between fertilizers, of interest were the bacteria Anaerolineace, Vulgatibacter, and Paenibacillus and the fungi Cochliobolus, Sordariales, and Dothideomycetes between CF and BF2, compared to the other genera contributing to the variability. Network analysis (co-occurrence network) showed that the network structure of bio-fertilizers was closer to the network characteristics of healthy soils, indicating that bio-fertilizers can improve soil health to some extent, and therefore if bio-fertilizers can be used as an alternative to chemical fertilizers in the future alternative, it is important to achieve green soil development and improve the climate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,847
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobial EcologyMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207