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Enregistrement W3199128283 · doi:10.1200/jco.2020.39.28_suppl.273

Development of patient reported outcomes-based machine learning algorithm for the six-month mortality prediction in patients with advanced cancer.

2021· article· en· W3199128283 sur OpenAlexaboutno aff
Ishwaria M. Subbiah, Cai Xu, Sheng-Chieh Lu, Ali Haider, Ahsan Azhar, Amy E Swan, Jaya Amaram‐Davila, Michael Tang, Yvonne Heung, Kaoswi Karina Shih, Éduardo Bruera, Chris Sidey‐Gibbons

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePsychosocialAlgorithmMachine learningCohortPhysical therapyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

273 Background: To date, studies of machine learning (ML) algorithms within oncology for mortality prediction have focused on structured electronic health record (EHR) data. Given the complex symptom burden of patients with advanced cancers, ML models may be better suited to identify patterns and interactions between symptom burden and outcomes compared to traditional statistical methods. To that end, in this study, we leverage the patient reported outcomes (PRO) data together with clinical EHR-based variables to assess the performance of ML algorithms to predict mortality in patients with advanced cancers. Methods: We randomly selected 689 patients with advanced cancer who had their first Palliative Care encounter between January 2012 and December 2017. 59 patients were lost to follow-up and were excluded from this analysis. The remaining cohort of 630 patients was split 4:1 randomly into a training and validation set to develop and test a supervised ML algorithm (Extreme Gradient Boosting [XGB] tree) to predict the 6-month mortality. Candidate variables for algorithm development included gender, age, ECOG performance status (PS), number of prior systemic therapies, and scores on the Edmonton Symptom Assessment System (ESAS)-FS, a 12-item PRO measure of physical and psychosocial symptom burden include the composite Physical Symptom Score (PHS), a sum of the physical ESAS symptoms (pain, fatigue, nausea, drowsiness, shortness of breath, appetite, wellbeing, sleep). Results: Overall, 630 patients were included in this 6-month mortality prediction; mean age 59 years, 354 (56%) female; 276 (44%) male. Variables with the most significant impact on the XGB tree mortality prediction were the ESAS symptoms of shortness of breath (1-AUC, 0.295), appetite, ESAS PHS, financial distress, age, and appetite as well as ECOG PS and number of prior systemic therapies. The XGB tree algorithm demonstrated the best overall prediction performance of 6-month mortality in the independent testing set, AUC 0.716 (95% CI 0.63 - 0.81), sensitivity 0.75 (95% CI 0.66 - 0.87), and a positive predictive value 0.67 (95% CI 0.57 - 0.79). Conclusions: Our ML model leveraged PRO-based assessment of symptom burden to correctly identify the majority of patients who died within 6 months. These models are uniquely positioned to not only automatically identify patients at high risk for short-term mortality but also the specific symptoms of concern for clinical intervention. Such models can be applied to available clinical and PRO data to facilitate clinical decision-making. Futures studies on improving model performance with the inclusion of interventions to modify symptom burden are in design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,429
Score d'incertitude au seuil0,560

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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