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Enregistrement W3199268013 · doi:10.7939/r3-3pdv-0e80

Evaluation of oilseed Brassica napus germplasm for days to flowering under a short-day condition and QTL mapping of the trait

2021· article· en· W3199268013 sur OpenAlexaboutno aff
Karanjot Gill

Notice bibliographique

RevueUniversity of Alberta Library · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermplasmBrassicaQuantitative trait locusBiologyAgronomyTraitGeneticsGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Canola (Brassica napus, AACC = 2n = 38) is an important oilseed crop in Canada. Among the different agronomic traits, the earliness of flowering and maturity are important for growing this crop on the Canadian prairies. The earliness of flowering can be improved by using the genes/alleles capable of promoting flowering under a short-day condition. In the present study, a genome wide association study (GWAS) was carried out by using SNP marker data and phenotypic data of days to flowering of 184 inbred lines, derived from six B. napus × B. oleracea interspecific crosses, grown under a 10 h photoperiod condition. Three QTL affecting days to flowering under this short-day condition were identified on chromosomes C1, C5 and C9. The effect of the C9 QTL was further confirmed by designing SSR markers from this QTL region and testing the markers on this inbred population. The early flowering C9 QTL allele could also be confirmed through evaluation of a set of B. napus lines under a short-day condition (10 h photoperiod) and genotyping the lines with these SSR markers. Near-isogenic lines (NILs) were also developed in this thesis research for C1 and C9 QTL, which have been mapped previously by using a population derived from Hi-Q × RIL-144 (carrying genome contents introgressed from B. oleracea var. alboglabra). Marker-assisted backcrossing enabled the introgression of these QTL alleles in the genetic background of Hi-Q. This is also evident from phenotypic evaluation of the NILs under a 10 h photoperiod condition where the NILs carrying the C1 or C9 QTL allele of RIL-144 flowered significantly earlier than the NILs carrying the Hi-Q allele. Thus, the results from this study provided evidence for the existence of diverse and valuable alleles in the C genome of B. oleracea which can be exploited in the breeding of B. napus canola.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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