HER2 Expression Discordance between Ductal Carcinoma In situ and Invasive Breast Carcinoma. How to Analyze Oncotype DX
Notice bibliographique
Résumé
Although histologically invasive breast carcinomas can be of no special subtype (ductal) or of special subtypes (as lobular carcinoma), based on their immunohistochemical and molecular features, they are subclassified in four different groups: luminal A, luminal B (with and without HER2 overexpression), HER2 subtype and triple negative. They vary in their gene expression signature, biological potential and clinical course. Luminal A subtype is considered to have a better prognosis and most are treated with hormone therapy alone after surgery because they express hormone receptors and show a low proliferation index. Oncotype DX (ODX) is a molecular score assay that estimates recurrence risk for early-stage hormone receptor-positive, human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) negative breast cancer. It can predict which tumours may benefit from adjuvant chemotherapy. It has been reported that occasionally a breast carcinoma can have immunohistochemical and molecular differences between the in situ and the invasive components. We report one case that may lead us to misinterpret ODX results, where the in situ ductal component amplified HER2 gene while invasive component did not. Therefore, carefulness must be taken when evaluating ODX results, and be sure that we are evaluating the invasive component.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».