Transcriptome profiling of mastitis-specialized Staphylococcus aureus reveals the impact of low-oxygenation on the regulation of unique pawthways after internalization into bovine mammary alveolar cell-T (MAC-T)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Mastitis-specialized lineages of Staphylococcus aureus are important pathogens in the dairy industry. The molecular mechanisms underlying host- and organ-specialization in these lineages are still not fully understood. Recent findings suggested that differential expression of genes may have contributed to the evolution of strains with enhanced virulence. However, studies on gene expressions under key intra-mammary conditions are quite limited for mastitis S. aureus . The purpose of the study was to investigate the influence of low oxygen levels on the transcriptome profiles of bovine matitis S. aureus , using high-throughput whole genome qRT-PCR.Results Results showed that under normal oxygenation, a mastitis-isolate expressed subsets of genes for adaptation, environmental-sensing, and binding including merR, sigB , vraS , yycG/yycF , araC , and tetR . In addition, coupling of fermentative metabolism to virulence was indicated by accumulated transcripts for catabolite control protein A ( ccpA) and pentose-monophosphate operon and depleted transcripts for tricaroxylic acid cycle. Furthermore, sarU mediated agr activation was evidented by transcripts for toxins, adaptation, and in-vivo viability factors as staphopains and gntR operon. On the other hand, reduced oxygenation increased transcription of fibrinogen-binding genes, isd- operon, and sdrH showing aggressive adherence phenotype. While normal oxygenation produced gene activities for quick and aggressive responses, low-oxygenation induced phenotypes for persistence, binding, and metabolic inactivity.Conclusion Significant differences in the transcriptional profiles were observed for mammary alveolar cell-T (MAC-T) internalized S. aureus under low oxygen levels compared to that at normal levels. This indicated that low oxygen is an important key mammary factor that influence transcriptome profiles of intra-mammary-specific phenotypes of S. aureus . These findings will help in understanding the effect of oxygen on the differentiation and evolution of intramammary S. aureus .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».