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Enregistrement W3199708972 · doi:10.1155/2021/4998786

Automatic Quantification of Atherosclerosis in Contrast-Enhanced MicroCT Scans of Mouse Aortas Ex Vivo

2021· article· en· W3199708972 sur OpenAlex
Vincent A. Stadelmann, Gabrielle Boyd, Martin Guillot, Jean-Guy Bienvenu, Charles Glaus, Aurore Varela

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biomedical Imaging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced X-ray and CT Imaging
Établissements canadiensCanadian Nuclear Laboratories
Organismes subventionnairesAmgen
Mots-clésEx vivoContrast (vision)MedicineIn vivoComputer scienceArtificial intelligenceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective. While microCT evaluation of atherosclerotic lesions in mice has been formally validated, existing image processing methods remain undisclosed. We aimed to develop and validate a reproducible image processing workflow based on phosphotungstic acid-enhanced microCT scans for the volumetric quantification of atherosclerotic lesions in entire mouse aortas. Approach and Results. 42 WT and 42 apolipoprotein E knockout mouse aortas were scanned. The walls, lumen, and plaque objects were segmented using dual-threshold algorithms. Aortic and plaque volumes were computed by voxel counting and lesion surface by triangulation. The results were validated against manual and histological evaluations. Knockout mice had a significant increase in plaque volume compared to wild types with a plaque to aorta volume ratio of 0.3%, 2.8%, and 9.8% at weeks 13, 18, and 26, respectively. Automatic segmentation correlated with manual ( <math xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"> <msup> <mrow> <mi>r</mi> </mrow> <mrow> <mn>2</mn> </mrow> </msup> <mo>≥</mo> <mn>0.89</mn> </math> ; <math xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"> <mi>p</mi> <mo>&lt;</mo> <mn>.001</mn> </math> ) and histological evaluations ( <math xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M3"> <msup> <mrow> <mi>r</mi> </mrow> <mrow> <mn>2</mn> </mrow> </msup> <mo>&gt;</mo> <mn>0.96</mn> </math> ; <math xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M4"> <mi>p</mi> <mo>&lt;</mo> <mn>.001</mn> </math> ). Conclusions. The semiautomatic workflow enabled rapid quantification of atherosclerotic plaques in mice with minimal manual work.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,430

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle