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Enregistrement W3199745819 · doi:10.1101/2021.09.08.21254232

Genome-wide association study of REM sleep behavior disorder identifies novel loci with distinct polygenic and brain expression effects

2021· preprint· en· W3199745819 sur OpenAlexafffund
Lynne Krohn, Karl Heilbron, Cornelis Blauwendraat, Regina H. Reynolds, Eric Yu, Konstantin Senkevich, Uladzislau Rudakou, Mehrdad A. Estiar, Emil K. Gustavsson, Kajsa Brolin, Jennifer A. Ruskey, Kathryn Freeman, Farnaz Asayesh, Ruth Chia, Isabelle Arnulf, Jacques Montplaisir, Jean‐François Gagnon, Alex Désautels, Yves Dauvilliers, Gian Luigi Gigli, Mariarosaria Valente, Francesco Janes, Andrea Bernardini, Birgit Högl, Ambra Stefani, Abubaker Ibrahim, Karel Šonka, David Kemlink, Wolfgang H. Oertel, Annette Janzen, Giuseppe Plazzi, Francesco Biscarini, Elena Antelmi, Michela Figorilli, Monica Puligheddu, Brit Mollenhauer, Claudia Trenkwalder, Friederike Sixel‐Döring, Valérie Cochen De Cock, Christelle Monaca, Anna Heidbreder, Luigi Ferini‐Strambi, Femke Dijkstra, Mineke Viaene, Beatriz Abril, Bradley F. Boeve, Sonja W. Scholz, Mina Ryten, Sara Bandrés‐Ciga, Alastair J. Noyce, P. F. Cannon, Lasse Pihlstrøm, Mike A. Nalls, Andrew Singleton, Guy A. Rouleau, Ronald B. Postuma, Ziv Gan‐Or

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalUniversité de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de MontréalMcGill UniversityCanadian Sleep & Circadian NetworkMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchCanada First Research Excellence FundConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementWellcome TrustMcGill UniversityMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésGenome-wide association studySynucleinopathiesGenetic architectureNeuroscienceBiologyColocalizationGenetic associationGeneticsPsychologyMedicineGeneSingle-nucleotide polymorphismQuantitative trait locusDiseaseAlpha-synucleinInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Rapid eye movement (REM) sleep behavior disorder (RBD), enactment of dreams during REM sleep, is an early clinical symptom of alpha-synucleinopathies. RBD also defines more severe forms of alpha-synucleinopathies. The genetic background of RBD and its underlying mechanisms are not well understood. Here, we performed the first genome-wide association study of RBD, identifying five RBD risk loci. Expression analyses highlight SNCA-AS1 and SCARB2 differential expression in different brain regions in RBD, with SNCA-AS1 further supported by colocalization analyses. Genetic risk score and other analyses provide further insights into RBD genetics, highlighting RBD as a unique subpopulation that will allow future early intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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