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Enregistrement W3199746330 · doi:10.30466/vrf.2020.116932.2778

Phylogenetic analysis and pathological characterization of fowl adenovirus isolated during inclusion body hepatitis outbreak in Tubas, Palestine.

2021· article· en· W3199746330 sur OpenAlexaboutno aff
Ibrahim Alzuheir, Nasr Jalboush, Adnan Fayyad, Rosemary Daibes

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenBankSerotypeBiologyVirologyPhylogenetic treeOutbreakFowlBroilerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fowl adenoviruses (FAdVs) associated with inclusion body hepatitis (IBH) was identified in commercial broiler chickens in Palestine. Investigated birds showed primary clinical signs and lesions of IBH including growth retardation, congested and enlarged liver with necrosis, petechial hemorrhage and basophilic intra-nuclear inclusion bodies. The mortality rate was from 15.00%. The FAdV was detected and sequenced in the liver samples of infected chicken by polymerase chain reaction using hexon gene-specific primers. Phylogenetic analysis revealed that FAdVs belong to FAdV-D serotype 10, clustered within the European highly pathogenic isolates. The highest nucleotide sequence similarity was 99.48% with highly pathogenic FAdV-D serotype 10 detected from infected chicken in Poland (GenBank: LN907532.1) and FAdV-D from infected chicken in Sweden (GenBank: HE961828.1). The lowest similarity was 93.46% with Canadian FAdV-D (GenBank: EF685576.1). In conclusion, this is the first report describing the presence of IBH revealing that the causative virus is closely similar to the highly pathogenic FAdV-D serotype 10 of IBH in broiler chickens in Palestine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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