Phylogenetic analysis and pathological characterization of fowl adenovirus isolated during inclusion body hepatitis outbreak in Tubas, Palestine.
Notice bibliographique
Résumé
Fowl adenoviruses (FAdVs) associated with inclusion body hepatitis (IBH) was identified in commercial broiler chickens in Palestine. Investigated birds showed primary clinical signs and lesions of IBH including growth retardation, congested and enlarged liver with necrosis, petechial hemorrhage and basophilic intra-nuclear inclusion bodies. The mortality rate was from 15.00%. The FAdV was detected and sequenced in the liver samples of infected chicken by polymerase chain reaction using hexon gene-specific primers. Phylogenetic analysis revealed that FAdVs belong to FAdV-D serotype 10, clustered within the European highly pathogenic isolates. The highest nucleotide sequence similarity was 99.48% with highly pathogenic FAdV-D serotype 10 detected from infected chicken in Poland (GenBank: LN907532.1) and FAdV-D from infected chicken in Sweden (GenBank: HE961828.1). The lowest similarity was 93.46% with Canadian FAdV-D (GenBank: EF685576.1). In conclusion, this is the first report describing the presence of IBH revealing that the causative virus is closely similar to the highly pathogenic FAdV-D serotype 10 of IBH in broiler chickens in Palestine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».