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Enregistrement W3199795788 · doi:10.1111/cts.13115

Nicotine metabolism and its association with CYP2A6 genotype among Indigenous people in Alaska who smoke

2021· article· en· W3199795788 sur OpenAlexafffund
Krista R. Schaefer, Jaedon P. Avey, Michael R. Todd, Julie A. Beans, Denise A. Dillard, Laura M. Shireman, Timothy A. Thornton, Rachel F. Tyndale, Kenneth E. Thummel, Renee Robinson, Katrina G. Claw

Notice bibliographique

RevueClinical and Translational Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSmoking Behavior and Cessation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchAgency for Healthcare Research and QualityNational Institutes of Health
Mots-clésCYP2A6GenotypeIndigenousNicotineSmokeMedicineMetabolismAssociation (psychology)BiologyPhysiologyDemographyGerontologyBioinformaticsGeneticsInternal medicinePsychologyGeographyGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prevalence of smoking is higher in Alaska Native and American Indian (ANAI) populations living in Alaska than the general US population. Genetic factors contribute to smoking and cessation rates. The objective of this study was to compare CYP2A6 genetic variation and CYP2A6 enzyme activity toward nicotine in an ANAI population. ANAI ( N = 151) people trying to quit smoking were recruited. DNA samples were genotyped for CYP2A6 variants *1X2A , *1B , *2 , *4 , *9 , *10 , *12 , and *35 . Multiple nicotine metabolites were measured in plasma and urine samples, including cotinine and 3′‐hydroxycotinine used to determine CYP2A6 activity (e.g., nicotine metabolite ratio [NMR]). We calculated summary statistics for all of the genotypes and metabolites and assigned CYP2A6 activity scores based on known information. We studied the association of CYP2A6 variants with the NMR and smoking histories. The overall frequency of the CYP2A6*1B gain of function allele was high in the ANAI versus non‐ANAI populations in other studies. Both *4 null and *9 decrease of function alleles had frequencies similar to previous studies of ANAI populations. In a multivariate analysis, the genotype‐inferred CYP2A6 activity score was associated with both plasma and urine NMR ( p value = 8.56E‐08 and 4.08E‐13, respectively). Plasma NMR was also associated with duration of smoking ( p value < 0.01) but not urinary total nicotine equivalents uncorrected for creatinine (TNE9 uc ) or biological sex. Urine NMR was significantly associated ( p value < 0.01) with TNE9 uc . Variation in NMR in this ANAI population is explained in part by CYP2A6 genetic variation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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