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Enregistrement W3200056708 · doi:10.3390/metabo11090633

A Targeted Serum Metabolomics GC-MS Approach Identifies Predictive Blood Biomarkers for Retained Placenta in Holstein Dairy Cows

2021· article· en· W3200056708 sur OpenAlexafffund
Guanshi Zhang, Dawid Tobolski, Grzegorz Zwierzchowski, Rupasri Mandal, David S. Wishart, Burim N. Ametaj

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Livestock and Meat AgencyGenome AlbertaUniversity of Alberta
Mots-clésRetained placentaMetritisMetabolomicsDairy cattlePlacentaMetabolomeCreatinineIce calvingAnimal scienceInternal medicineChemistryMedicineBiologyLactationPregnancyChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The retained placenta is a common pathology of dairy cows. It is associated with a significant drop in the dry matter intake, milk yield, and increased susceptibility of dairy cows to metritis, mastitis, and displaced abomasum. The objective of this study was to identify metabolic alterations that precede and are associated with the disease occurrence. Blood samples were collected from 100 dairy cows at -8 and -4 weeks prior to parturition and on the day of retained placenta, and only 16 healthy cows and 6 cows affected by retained placenta were selected to measure serum polar metabolites by a targeted gas chromatography-mass spectroscopy (GC-MS) metabolomics approach. A total of 27 metabolites were identified and quantified in the serum. There were 10, 18, and 17 metabolites identified as being significantly altered during the three time periods studied. However, only nine metabolites were identified as being shared among the three time periods including five amino acids (Asp, Glu, Ser, Thr, and Tyr), one sugar (myo-inositol), phosphoric acid, and urea. The identified metabolites can be used as predictive biomarkers for the risk of retained placenta in dairy cows and might help explain the metabolic processes that occur prior to the incidence of the disease and throw light on the pathomechanisms of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,707
Score d'incertitude au seuil0,625

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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