The Influence of Single Nucleotide Polymorphisms of NOD2 or CD14 on Susceptibility to Tuberculosis: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Tuberculosis (TB) is still one of the leading causes of death worldwide. Genetic studies have pointed to the relevance of the NOD2 and CD14 polymorphic alleles in association with susceptibility or resistance to TB. Methods: A systematic review was performed on search platforms to examine the association between single nucleotide polymorphisms (SNP) and TB risk. Study quality was evaluated using the Newcastle-Ottawa Quality Scale (NOQS) Results: Thirteen studies matched the selection criteria. Of those, 9 investigated CD14 SNPs, and 6 reported a significant association between the T allele and TT genotypes of the rs2569190 SNP and increased TB risk. In contrast, the genotype CC was found to be protective against the disease. Furthermore, in two studies, rs2569191 SNP of the CD14, G allele was described to be significantly associated with increased TB risk. Four studies reported data uncovering the relationship between NOD2 SNPs and TB risk, with two of them reporting significant associations of rs1861759 and rs7194886 and higher TB risk in a Chinese Han population. Paradoxically, minor allele carriers (CG or GG) of rs2066842 and rs2066844 NOD2 SNPs were associated with lower TB risk in African Americans. Conclusions: The CD14 rs2569190 and rs2569191 polymorphisms influence TB risk depending on the allele. Furthermore, there is significant association between NOD2 SNPs rs1861759 and rs7194886 and augmented risk of TB, especially in persons with Chinese ethnicity. The referred polymorphisms of CD14 and NOD2 genes likely play an important role in TB susceptibility and physiopathology; such effect may be affected by ethnicity.Systematic review registration: CRD42020186523
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,008 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».