Diversity and Metabolic Potential of Microbial Communities in a Serpentinite-Hosted Spring at the Tablelands
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The geochemical process of serpentinization releases energy and organic carbon: two of the basic requirements needed to support life. Sites of active serpentinization in the deep subsurface provide the intriguing possibility of a non-photosynthetically-supported biosphere. However, serpentinization also creates conditions, such as high pH and limited electron acceptors, which may limit microbial growth and diversity. Gaining an understanding of the identity and metabolic potential of microbes that thrive in these environments may provide insight as to whether serpentinization is sufficient to independently support life. Tablelands Ophiolite in Gros Morne National Park, Newfoundland, Canada is a continental site of serpentinization where serpentinite springs form surface pools. These pools provide easy sampling access to subsurface fluids and may allow for sampling of the subsurface microbial community. However, identification of members of the subsurface community in these pools is complicated by both surface contamination and contamination by organisms that inhabit the transition zone where hydrogen-rich subsurface fluids meet oxygen-rich surface fluids. This study was designed to distinguish among these potential sources of microorganisms by using a sampling technique that more effectively samples subsurface fluids. Community dissimilarity comparisons using environmental 16S rRNA gene sequencing indicate that the sampling design led to more direct access to subsurface fluids. These results are supported by metagenomic analyses that show metabolic pathways consistent with non-photosynthetic carbon fixation in the samples expected to represent subsurface fluids and that show hydrogen oxidation pathways in samples associated with the surface sources. These results provide a clearer picture of the diversity and metabolic potential of microbial communities potentially inhabiting subsurface, serpentinite-hosted habitats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».