Zoonotic infection and clonal dissemination of <i>Streptococcus equi</i> subspecies <i>zooepidemicus</i> sequence type 194 isolated from humans in Thailand
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus equi subsp. zooepidemicus (SEZ) is a zoonotic pathogen associated with diseases in a wide range of animals as well as in humans. SEZ sequence type (ST) 194 strains have been associated with outbreaks in China, the USA, and Canada and have caused high mortality in pigs. Nevertheless, human infection by this ST has never been reported. This study conducted a retrospective analysis of 18 SEZ strains from human patients in Thailand during 2005-2020. The study revealed clonal dissemination of ST194 with the identical pulsotype in human patients throughout Thailand. Clinical manifestation was mainly septicemia (61.1%), while 72.2% had a history of eating raw pork products. There were six fatal cases (33.3%). Antimicrobial susceptibility testing revealed that all strains were susceptible to penicillin, ampicillin, cefotaxime, erythromycin, levofloxacin, clindamycin, chloramphenicol, tetracycline and vancomycin. Virulence-associated genes, including bifA, szM, szP, sdzD, spaZ, and fszF, were present in all tested strains. Some representative genes in four pathogenicity islands found in the swine outbreak SEZ-ATCC35246 (ST194) strain were detected in these SEZ strains. Whole-genome sequencing analysis of three representative SEZs in this study revealed no acquired antimicrobial-resistant genes and they contained the same virulence factors. The single-nucleotide polymorphism phylogenetic tree demonstrated that the current strains were clustered with swine ST194 strains. The results should be highlighted as a public health concern, especially to those who may directly or indirectly have contact with livestock or companion animals or have consumed raw meat products as risk factors for infections with SEZ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».