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Enregistrement W3200764205 · doi:10.3389/fmicb.2021.735022

Shifts in Soil Structure, Biological, and Functional Diversity Under Long-Term Carbon Deprivation

2021· article· en· W3200764205 sur OpenAlexaff
Paul B. L. George, David B. Fidler, Joy D. Van Nostrand, Jonathan A. Atkinson, Sacha J. Mooney, Simon Creer, Robert I. Griffiths, James E. McDonald, David A. Robinson, Davey L. Jones

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesCranfield UniversityBritish Geological SurveyBangor UniversitySight Research UKJames Hutton Institute
Mots-clésSoil waterSoil organic matterBiologyMicrobial population biologyMineralization (soil science)EcologyEnvironmental chemistryChemistryAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soil organic matter is composed of a variety of carbon (C) forms. However, not all forms are equally accessible to soil microorganisms. Deprivation of C inputs will cause changes in the physical and microbial community structures of soils; yet the trajectories of such changes are not clear. We assessed microbial communities using phospholipid fatty acid profiling, metabarcoding, CO2 emissions, and functional gene microarrays in a decade-long C deprivation field experiment. We also assessed changes in a range of soil physicochemical properties, including using X-ray Computed Tomography imaging to assess differences in soil structure. Two sets of soils were deprived of C inputs by removing plant inputs for 10 years and 1 year, respectively. We found a reduction in diversity measures, after 10 years of C deprivation, which was unexpected based on previous research. Fungi appeared to be most impacted, likely due to competition for scarce resources after exhausting the available plant material. This suggestion was supported by evidence of bioindicator taxa in non-vegetated soils that may directly compete with or consume fungi. There was also a reduction in copies of most functional genes after 10 years of C deprivation, though gene copies increased for phytase and some genes involved in decomposing recalcitrant C and methanogenesis. Additionally, soils under C deprivation displayed expected reductions in pH, organic C, nitrogen, and biomass as well as reduced mean pore size, especially in larger pores. However, pore connectivity increased after 10 years of C deprivation contrary to expectations. Our results highlight concurrent collapse of soil structure and biodiversity following long-term C deprivation. Overall, this study shows the negative trajectory of continuous C deprivation and loss of organic matter on a wide range of soil quality indicators and microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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