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Enregistrement W3200834259 · doi:10.1101/2021.09.14.460368

Disruption of the autism-associated gene <i>SCN2A</i> alters synaptic development and neuronal signaling in patient iPSC-glutamatergic neurons

2021· preprint· en· W3200834259 sur OpenAlexafffund
Chad O. Brown, Jarryll Uy, Nadeem Murtaza, Elyse Rosa, Alexandria Alfonso, Sansi Xing, Biren M. Dave, Savannah Kilpatrick, Annie A. Cheng, Sean H. White, Jennifer Howe, Stephen W. Scherer, Yu Lu, Karun K. Singh

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neural Engineering
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoMcMaster UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcMaster UniversityCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenAutism Speaks
Mots-clésGlutamatergicSynapseSodium channelBiologyExcitatory postsynaptic potentialNeuroscienceNeurotransmissionInduced pluripotent stem cellCell biologyGeneChemistryGeneticsGlutamate receptorReceptorSodiumInhibitory postsynaptic potentialEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY SCN2A is an autism spectrum disorder (ASD) risk gene and encodes a voltage-gated sodium channel. However, the impact of autism-associated SCN2A de novo variants on human neuron development is unknown. We studied SCN2A using isogenic SCN2A -/- induced pluripotent stem cells (iPSCs), and patient-derived iPSCs harboring a p.R607* or a C-terminal p.G1744* de novo truncating variant. We used Neurogenin2 to generate excitatory glutamatergic neurons and found that SCN2A +/ p . R607 * and SCN2A -/- neurons displayed a reduction in synapse formation and excitatory synaptic activity using multielectrode arrays and electrophysiology. However, the p.G1744* variant, which leads to early-onset seizures in addition to ASD, altered action-potential dynamics but not synaptic activity. Proteomic and functional analysis of SCN2A +/ p . R607 * neurons revealed defects in neuronal morphology and bioenergetic pathways, which were not present in SCN2A +/ p . G1744 * neurons. Our study reveals that SCN2A de novo variants can have differential impact on human neuron function and signaling. HIGHTLIGHTS - Isogenic SCN2A -/- neurons display intrinsic hyperexcitability and impaired excitatory synapse function - SCN2A +/ p . R607 * variant reduces excitatory synapse function in patient neurons - C-terminal SCN2A +/ p . G1744 * variant enhances action potential properties but not synaptic transmission in patient neurons - SCN2A +/ p . R607 * variant display impacts on morphological and bioenergetic signaling networks through proteomic and functional analysis eTOC - Brown et al. examined Autism-associated SCN2A variants using patient-derived iPSC NGN2-neurons. They discover that genetic variants differentially impact neuronal development and synaptic function, and highlight neuronal and bioenergetic signaling networks underlying SCN2A loss-of-function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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