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Enregistrement W3201035602 · doi:10.1101/2021.09.01.21262503

Huntington’s Disease Integrated Staging System (HD-ISS): A Novel Evidence-Based Classification System For Staging

2021· preprint· en· W3201035602 sur OpenAlexaff
Sarah J. Tabrizi, Scott Schobel, Emily C. Gantman, Alexandra Mansbach, Beth Borowsky, Pavlina Konstantinova, Tiago Mestre, Jennifer Panagoulias, Christopher A. Ross, Maurice Zauderer, Ariana P. Mullin, Klaus Romero, Sudhir Sivakumaran, Emily C. Turner, Jeffrey D. Long, Cristina Sampaio

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthMonash UniversityUniversity College LondonCHDI Foundation
Mots-clésHuntington's diseaseStage (stratigraphy)DiseaseObservational studyInternal medicinePsychologyMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Despite the monogenic autosomal dominant nature of Huntington’s disease (HD), the current research paradigm is still based on overt clinical phenotypes and does not address disease pathobiology and biomarkers that are evident decades before functional decline. A new research framework is needed to standardize clinical research and enable interventional studies earlier in the course of HD. Methods The HD Regulatory Science Consortium (HD-RSC), a precompetitive Critical Path Institute initiative that includes 37 member organizations, created the Regulatory Science Forum working group (RSF), which includes industry and academic representatives. To generate a new evidenced-based HD Integrated Staging System (HD-ISS) using a formal consensus methodology, the RSF considered prognostic biomarkers, signs, and symptoms of HD, and performed empirical data analysis. We used observational data to calculate healthy-control-based landmark variable cut-offs for Stage classification and to internally validate the framework. Findings The HD-ISS starts with Stage 0, which comprises individuals with ≥ 40 cytosine-adenine-guanine repeats (CAG) in the huntingtin gene ( HTT ), before detectable indications of disease. We concluded that detectable HD progression is verified with measurable indicators of underlying pathophysiology (Stage 1), proceeds to a detectable clinical phenotype (Stage 2), and continues to a decline in function (Stage 3). Operationally, individuals can be unambiguously classified into Stages 1-3 based on CAG-independent thresholds of landmark assessments. Both cross-sectional status and longitudinal HD-ISS Stage progress align with HD natural history, and Stage transitions accelerate as CAG increase. Interpretation The HD-ISS encompasses the full course of HD starting at birth, defined by the presence of the genetic expansion. This new framework aims to standardize language for clinical research and its immediate use will enable further validation. The HD-ISS provides structure to harmonize clinical study populations and facilitates the clinical assessment of interventions earlier in HD to prevent or slow disease progression. Funding CHDI Foundation Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0100,005
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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