Microencapsulation And Subsequent In-Situ Incubation Of Marine Bacteria For The Discovery Of Novel Natural Products
Notice bibliographique
Résumé
Despite difficulty in successfully culturing the vast majority of microbes present within the natural world, microbes continue to be a significant source of natural products.Consequently, various methods, including, but not limited to, modification of media composition and growth characteristics, single cell isolation, and in-situ incubation, have been employed over the years in an attempt to improve microbial recovery from environmental samples.To improve microbial recovery, the effect of microencapsulation followed by in-situ incubation on the abundance, viability and diversity of bacteria recovered from marine sediment samples was examined.Marine bacteria dislodged from sediments samples were concentrated by centrifugation and either resuspended (control) or encapsulated and then incubated within modified dialysis cassettes for a week in their natural environment.The effect of encapsulation and in situ incubation on the recovery of marine sediment bacteria was determined by assessing abundance, viability and diversity before and after incubation.While the abundance, viability and diversity were not significantly different between resuspended and encapsulated samples before incubation, significant differences were observed between the samples following in situ incubation.The abundance of colonies observed for the resuspended samples was significantly greater than that of the encapsulated samples, while the viability and diversity of encapsulated samples was significantly greater than the resuspended samples.The results of this study suggest microencapsulation followed by in-situ incubation results in recovery of a different composition of bacteria compared to traditional cultivation, thus improving the diversity of bacteria recovered from marine sediment.Conversely, the greater abundance of growth observed from resuspended samples is likely due to the overgrowth of more common, faster growing species rather than rare species as both overall viability and diversity of resuspended samples were significantly lower than encapsulated samples.While future studies should aim to perform a comprehensive assessment of bacterial diversity obtained using this new technique, this pilot study indicates the benefits of microencapsulation followed by in-situ incubation compared to previous culture methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».