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Enregistrement W3201086905

Genomic evaluation for feed efficiency in Canadian Holsteins

2021· article· en· W3201086905 sur OpenAlexaffabout
J. Jamrozik, G.J. Kistemaker, P G Sullivan, Brian Van Doormaal, Tati Chud, Christine F. Baes, Flávio S. Schenkel, F. Miglior

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeritabilityResidual feed intakeAnimal scienceLactationDry matterBiologyFeed conversion ratioBody weightStatisticsMathematicsGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic evaluation was developed for feed efficiency for Canadian Holsteins, with the first official release in April 2021. The model defines all traits in two periods of first lactation: 5-60  and 61-305 days in milk. Traits are: a) Metabolic Body Weight (MBW), calculated as (body weight) 0.75 ; b) Energy Corrected Milk (ECM), calculated as 0.25*Milk + 12.2*Fat + 7.7*Protein; and c) Dry Matter Intake (DMI). All traits are weekly averages expressed in kg/day (ECM and DMI) or kg 0.75 (MBW). Single-step method is used to fit the multiple-trait linear animal model for 6 traits (ECM, MBW, and DMI, in two DIM intervals) with genotypic information, using the MiX99 software. GEBV of DMI are re-parameterized using linear regressions of DMI on ECM and MBW, giving a measure of feed efficiency (RFI) genetically independent of ECM and MBW.  Genetic parameters were estimated using 99,713 weekly records on 4,952 cows. Heritability of RFI was 0.10 and 0.05 for early and later periods in first lactation, respectively, and were smaller than estimates for DMI (0.29 and 0.27). By definition, RFI and the energy sink traits were genetically uncorrelated. Correlations between DMI and RFI were 0.50 and 0.37 for first and second DIM intervals, respectively. Finally, RFI in 5-60 DIM was genetically less correlated with RFI in 61-305 DIM compared to DMI between these two DIM intervals (0.63 vs. 0.88). Estimated breeding values (GEBV) for RFI are reversed in sign and proofs are expressed as RBV (mean = 100 and SD = 5, for base bulls). Proofs for RFI in 61 – 305 DIM, labeled as Feed Efficiency (FE), are considered a principal selection criterion for feed efficiency in Canadian Holsteins. Average reliability of FE for young genomic bulls was 0.41.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,462
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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