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Enregistrement W3201340411

Genomic Evaluation for Resistance to Fertility Disorders in Canadian Dairy Breeds

2021· article· en· W3201340411 sur OpenAlexaboutno aff
J. Jamrozik, G.J. Kistemaker, Brian Van Doormaal, Christine F. Baes, F. Miglior

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeritabilityFertilityBiologyTraitLactationIce calvingGenetic correlationGeneticsDairy cattleMetritisAnimal scienceVeterinary medicineDemographyGenetic variationPregnancyGeneMedicinePopulation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic evaluation was developed for resistance to fertility disorders in Canadian Ayrshire, Holstein and Jersey breeds, with the first official release in December 2020. The evaluation model includes the following traits: CO = Cystic Ovaries, MET = Metritis, and RP = Retained Placenta. All traits are scored as 0 (no case) or 1 (at least one case) in the period from calving to 305 d, 150 d, and 14 d after calving, for CO, MET and RP, respectively. First and later lactation traits are treated as different but correlated traits. Observations from lactations >2 are repeated records of lactation 2. The model is a multiple-trait (6 traits) linear animal model. Genomic information is utilized in additive relationships among animals via single-step method implemented in the MiX99 software. Genetic parameters were estimated using a subset (N= 76,082) of Holstein data. Heritability for fertility disorders ranged from 0.02 to 0.03. Genetic correlation between fertility disorders expressed in first and later lactation cows were between 0.55 (CO) and 0.70 (MET). This confirmed that disease resistance to fertility disorders are genetically different traits in first and later parities. Resistance to CO was genetically uncorrelated with resistance to 2 other disorders within and across parities (correlations did not statistically differ from 0). MET and RP were moderately genetically correlated (0.44 to 0.54). Estimated genomic breeding values for all traits are reversed in sign. Three additional evaluations are created by combining proofs for first and later lactation for a given disorder with equal weights. All proofs are expressed as RBV (mean = 100 and SD = 5, for base bulls).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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