Genomic Evaluation for Resistance to Fertility Disorders in Canadian Dairy Breeds
Notice bibliographique
Résumé
Genomic evaluation was developed for resistance to fertility disorders in Canadian Ayrshire, Holstein and Jersey breeds, with the first official release in December 2020. The evaluation model includes the following traits: CO = Cystic Ovaries, MET = Metritis, and RP = Retained Placenta. All traits are scored as 0 (no case) or 1 (at least one case) in the period from calving to 305 d, 150 d, and 14 d after calving, for CO, MET and RP, respectively. First and later lactation traits are treated as different but correlated traits. Observations from lactations >2 are repeated records of lactation 2. The model is a multiple-trait (6 traits) linear animal model. Genomic information is utilized in additive relationships among animals via single-step method implemented in the MiX99 software. Genetic parameters were estimated using a subset (N= 76,082) of Holstein data. Heritability for fertility disorders ranged from 0.02 to 0.03. Genetic correlation between fertility disorders expressed in first and later lactation cows were between 0.55 (CO) and 0.70 (MET). This confirmed that disease resistance to fertility disorders are genetically different traits in first and later parities. Resistance to CO was genetically uncorrelated with resistance to 2 other disorders within and across parities (correlations did not statistically differ from 0). MET and RP were moderately genetically correlated (0.44 to 0.54). Estimated genomic breeding values for all traits are reversed in sign. Three additional evaluations are created by combining proofs for first and later lactation for a given disorder with equal weights. All proofs are expressed as RBV (mean = 100 and SD = 5, for base bulls).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».